北京PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒代理价格

时间:2021年06月29日 来源:

    SLAMseq代谢标记试剂盒产品应用测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。 云生物就带您了解一下Lexogen试剂盒的特点。北京PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒代理价格

CORALLTotalRNA-seq文库构建试剂盒CORALL试剂盒:可以在(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。产品优势:完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析;整合UMIs,准确反映转录本信息;出色的链特异性(>99%)操作流程;低起始量(1ng-1μg),兼容mRNA捕获及核糖体去除建库;适用低起始量或低质量的FFPE样本;自动化友好。工作流程:CORALL文库构建基于特有的链置换终止和连接技术,首先置换终止引物(DSP,包含P7序列)3’端可随机结合到RNA模板上,然后进行反转录延伸,当延伸到下一个DSP时,延伸终止,因此文库构建过程不需要进行片段化。插入片段的大小取决于两个结合到模板RNA上DSP的距离。此外,这种终止可阻止伪第二链的合成,保持出色的链特异性。寡核苷酸连接序列可以与**链cDN**段的3’端进行高效的连接,同时引入P5序列和单分子标签(UMIs)。通过PCR进行第二链的合成和双链cDNA扩增,同时把i7和i5(可选)端index以及簇生成所需的完整接头序列引入到文库中。所有的核酸纯化都使用磁珠,操作流程高度匹配自动化。 上海RNA质控标准品Lexogen试剂盒代理价格上海Lexogen试剂盒代理哪家好?

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Quanteq pool样品barcode 3‘ mRNA-seq文库构建试剂盒:产品优势:对于筛查项目是高性价比的基因表达分析方法批量处理,省时、省力、省成本可从几个样本到36,864个样本的批量处理。简介:迄今为止,基因表达谱分析是RNA-Seq在生物医学研究和诊断中**常用的应用。传统的基因表达项目使用mRNA测序技术,可以对全长转录本进行单核苷水平的***解析,但对样品处理数量有限,成本高。尽管测序的价格在持续下降,样品制备、测序和数据处理仍然是限制高通量筛选的主要成本。




云生物主营Lexogen试剂盒。

    SLAMseq代谢标记试剂盒:标准的RNA-seq方法可以评估总RNA丰度,但不能解决RNA转录和降解整体动态水平的动力学问题。SLAMseq系列产品以时间作为RNA-Seq的一个新维度,能同时对新合成的和已有的RNA进行定量分析。产品优势:可进行转录组--RNA合成及降解的动力学分析;获取控制基因表达的新见解;建立刺激诱导的RNA转录和降解之间序列改变的模型;通过比较新生转录水平,***提高差异表达的分辨率;只需向RNA-Seq工作流添加两个步骤,无需pull-down实验或生化隔离;对于时间分辨的RNA-seq,整合了Lexogen’sSLAMseq标记试剂盒,QuantSeq3’mRNA-Seq文库构建试剂盒,以及SLAMdunk分析软件。工作流程:SLAMseq系列产品是基于一种新的全转录组定量、快速和可靠的标记方法:通过硫醇(SH)烷基化标记用于RNA的代谢测序1。用核苷酸类似物4-硫代嘌呤(4-Thiouridine,S4U)与细胞孵育,S4U被细胞摄入,并整合到新转录的,新生的RNA中。该工作流程的关键特点是烷基化步骤,使用碘乙酰胺(iodoacetamide,IAA)修饰S4U核苷酸,导致核苷酸在逆转录过程中发生转化。因此,S4U标记的转录本,在测序读取过程中,会导致胸腺嘧啶变成胞嘧啶(T>C)。 Lexogen试剂盒的系列有很多种。上海磁珠纯化Lexogen试剂盒活动

Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?北京PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒代理价格

    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Performance3’端链特异性比对:以FDA提供的测序质控(SEQC)标准样品A和B为样本(A和B分别是ERCC外源RNA与有参RNA的混合物1和混合物2)1,2,用QuantSeq试剂盒进行文库构建,测序数据与近期生物分子资源设施协会(ABRF)发布的NGS研究中的mRNA-Seq数据组比对3。在标准mRNA-Seq中,测序Reads覆盖转录本的全长,而QuantSeq的Reads*覆盖转录本的3’端()。在该例子QuantSeq在精确的检测基因表达水平的同时,节省了大于90%的测序深度。由于spike-in转录本*来源于正义链的转录,因此链特异性的评估可以不依赖于于任何基因组注释。在各种情况下均显示出高于,而两个被评估的mRNA-SeqSEQC数据集(datasets)链特异性*分别为。QuantSeq可降低噪音,能够实现准确检测及定量反义转录本。QuantSeq量化范围宽--6个数量级:为了分析QuantSeq的基因计算准确性,用ERCC的spi-ke-in转录本覆盖reads数与input的分子数作图进行分析()。在线性模型评估和Spearman关联性评估中,QuantSeq展现出了非常高的input-output关联性和基因表达测定的准确性。 北京PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒代理价格

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