北京ployARNA选择Lexogen试剂盒销售
Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:QuantSeq3'mRNA-seq文库构建试剂盒是以mRNA靠近3'端序列进行文库构建,文库可兼容Illumina和IonTorrent测序平台。每个转录组本只产生一个片段,因此能准确进行基因表达定量,同时减少测序深度,能使更多样本混样测序。
产品优势:快速简单的一体化实验方案:从总RNA到可用于测序的文库时间不超过;每个转录本*有一个片段产生—可进行全基因组范围的基因表达分析;能稳定、灵敏检测低丰度的转录本;适用于低起始量(100pg(FWD)或10ng(REV)总RNA)及低质量RNA(如FFPE样本);可高效替代芯片检测或传统的RNA测序,友好匹配自动化工作站;在Blubee基因组分析平台上**进行数据分析;NEW!节约成本,优化的globinmRNA去除流程可用于QuantSeq文库构建;Dualindexes能支持9,216个i5/i7index,或者可选择96个uniqueindex,同时提供能够检测、排除扩增偏好性的UMIs。 云生物Lexogen试剂盒拥有完善的售后。北京ployARNA选择Lexogen试剂盒销售
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 浙江Lexogen i7 6 nt Index SetLexogen试剂盒要多少钱云生物作为上海一家专业的Lexogen试剂盒厂家。
Lexogen是一个为NGS技术提供创新性解决方案的生物公司。公司的主要专注于RNA测序技术的开发,以解决转录组的复杂性。Lexogen于2007年成立,在2013年发布了***款商业化产品。公司总部位于奥地利维也纳,北美办事处设在美国新罕布什尔州。SLAMseq Metabolic RNA Labeling Kit:通过区分新合成和已存在的RNA来分析RNA合成和降解;与Quantseq联合使用,在控制基因表达方面获取新的见解。SPLIT RNA Extraction Kit:不需要DNase,高产量,高效回收,***适用于各种分物种;可从同一个样本中纯化总RNA或小片段或大片段RNA;同样适用于血液RNA提取。QuantSeq3’mRNA-Seq Library PrepKits、QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library PrepKit:低成本基因表达谱分析-适用于低起始量,低质量以及血液样本。
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:良好的重现性和无脱靶效应:RiboCop表现出极好的稳定性的和重复性。相关图显示了不同重复之间极好的重现性。额外显示未经处理的与ribo-depleted样本转录本丰度之间有高度的相关性:不同的input范围,以及跨越不同物种。表明RiboCop去除细菌rRNA不会产生脱靶效应。RiboCop表现出极好的重现性。以10ng总RNA为input量的两个**实验结果表现出很好的一致性。总RNA分别用RiboCop革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌rRNA去除试剂盒处理。云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:SIRV-Set2:SIRV-Set2:等摩尔isoformMixE0。它非常适合于成本敏感的应用和RNA-Seq实验,这些实验只需对复杂的isoform混合物进行检测,而不需要很深的测序深度来覆盖不同浓度转录本。SIRV-Set2非常适用于一致性的计算,因为实验的指纹图谱*依赖于SIRVisoform的复杂性而非浓度差异。SIRV-Set3:该组包含MixE0和ERCCMix,二者各占50%。69个SIRVisoform转录本和92个无重叠的ERCCRNA的混合物满足了参入(Spike-in)RNA质控品的复杂性需求,可兼顾isoform的高度复杂性和宽浓度范围的试验特性。可对整个RNA测序工作流程进行更***的质量评估和监测,并获得技术细节以及用于比较**样本和实验间的指纹图谱。单一的isoformERCC转录本覆盖6个数量级的浓度,辅以等摩尔浓度的SIRVisoform。 使用Lexogen试剂盒的好处您了解多少呢?陕西TraPR功能性小RNA提取试剂盒Lexogen试剂盒报价
Lexogen试剂盒的好处您了解吗?北京ployARNA选择Lexogen试剂盒销售
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 北京ployARNA选择Lexogen试剂盒销售