Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒代理

时间:2021年05月11日 来源:

SLAMseq代谢标记试剂盒SLAM-ITseq: 确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达。对于该应用,将4-硫尿嘧啶(4-Thiouracil,不是LAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNA -seq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushima et al.,2018)。 SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM -ITseq数据兼容,可对其进行分析。Lexogen试剂盒的多种系列总有一款是您满意。Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒代理

    Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒代理想要买Lexogen试剂盒?您要先了解Lexogen试剂盒的特点。

    SmallRNA文库构建试剂盒:SmallRNA试剂盒建库流程简单,可在5个小时内完成smallRNA的建库(以totalRNA或富集好的smallRNA为模板)。可用于smallRNA的发现和分析,如microRNA或siRNA,这些smallRNA已被发现在基因表达调控中发挥关键作用。产品优势:5小时内即可完成测序文库的构建;input量范围宽:从50pg(富集好的smallRNA)或100ng(totalRNA)到1000ngRNA;适用于低RNA含量的样品,如血浆、血清和尿液;内含i7index,**多可同时对96个样品进行混样分析。工作流程:SmallRNA文库构建是通过将接头连接到TotalRNA或富集的smallRNA的3'和5'端。对于inputRNA,连接上5’端和3’端接头后,将反转录成cDNA,并通过PCR将i7端index引入到文库中,**多可以达96种index。通常情况下,特别是当inputRNA为富集好的microRNA时,构建好的文库可直接用于测序分析。对于totalRNA进行的smallRNA文库构建,可以用试剂盒中带的磁珠纯化模块除去接头自连片段,以及将smallRNA文库从totalRNA文库中分离出来。

CORALLTotalRNA-seq文库构建试剂盒CORALL试剂盒:可以在(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。产品优势:完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析;整合UMIs,准确反映转录本信息;出色的链特异性(>99%)操作流程;低起始量(1ng-1μg),兼容mRNA捕获及核糖体去除建库;适用低起始量或低质量的FFPE样本;自动化友好。工作流程:CORALL文库构建基于特有的链置换终止和连接技术,首先置换终止引物(DSP,包含P7序列)3’端可随机结合到RNA模板上,然后进行反转录延伸,当延伸到下一个DSP时,延伸终止,因此文库构建过程不需要进行片段化。插入片段的大小取决于两个结合到模板RNA上DSP的距离。此外,这种终止可阻止伪第二链的合成,保持出色的链特异性。寡核苷酸连接序列可以与**链cDN**段的3’端进行高效的连接,同时引入P5序列和单分子标签(UMIs)。通过PCR进行第二链的合成和双链cDNA扩增,同时把i7和i5(可选)端index以及簇生成所需的完整接头序列引入到文库中。所有的核酸纯化都使用磁珠,操作流程高度匹配自动化。 Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒QuantSeq-Pool与Quantseq结果高度一致。QuantSeq-Pool可获得与Quantseq一致的结果,两者有良好相关性,且重复性好。轻微的差异主要体现在mt转录本上,这主要是由于Quantseqpool和Quangtseq操作流程上的差异导致,如对于低input,10ng的RNAinput量,Quantseq需要使用低input的操作流程。QuantSeq-Pool结合了样本barcode标记和早期pooling与3'mRNASeq的优点,是一种节省时间、测序数据量和数据分析工作的基因表达谱分析方法。这意味着与传统的mRNA-Seq项目相比,总成本降低了10倍。input量通常可以低至10ng总RNA,内置的UMIs可以消除PCR带来的偏好性,从而实现高度可信、稳定的基因表达分析。便捷的操作流程可以手动进行高通量量处理样本,而且对于需要大规模混样测序的项目也可用自动化操作流程。 云生物主营Lexogen试剂盒。湖北Lexogen试剂盒代理价格

上海Lexogen试剂盒代理哪家好?Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒代理

Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:QuantSeq3'mRNA-seq文库构建试剂盒是以mRNA靠近3'端序列进行文库构建,文库可兼容Illumina和IonTorrent测序平台。每个转录组本只产生一个片段,因此能准确进行基因表达定量,同时减少测序深度,能使更多样本混样测序。

产品优势:快速简单的一体化实验方案:从总RNA到可用于测序的文库时间不超过;每个转录本*有一个片段产生—可进行全基因组范围的基因表达分析;能稳定、灵敏检测低丰度的转录本;适用于低起始量(100pg(FWD)或10ng(REV)总RNA)及低质量RNA(如FFPE样本);可高效替代芯片检测或传统的RNA测序,友好匹配自动化工作站;在Blubee基因组分析平台上**进行数据分析;NEW!节约成本,优化的globinmRNA去除流程可用于QuantSeq文库构建;Dualindexes能支持9,216个i5/i7index,或者可选择96个uniqueindex,同时提供能够检测、排除扩增偏好性的UMIs。 Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒代理

信息来源于互联网 本站不为信息真实性负责