数字PCR数字PCR专业服务
cdPCR主要以Fluidigm公司的BioMark HD系统以及Life Technology公司的QuantStudio 3D系统为**。Bio Mark系统采用微泵阀式芯片,以聚二甲基硅氧烷为芯片材料,主要依靠微流控通道与阀门的开闭进行原始体系分割,在芯片的反应仓进行PCR反应,然后通过类似于基因芯片的方法扫描每个通孔的荧光信号,进行目的序列含量的计算。QuantStudio 3D系统采用阵列微池式芯片,反应液由进样孔直接进入各微反应池。芯片式dPCR生成微滴体积均一,具有较高的稳定性,体系之间影响较小,但技术操作复杂,通量有限且实验成本较高。基于单分子快速PCR扩增,进行核酸拷贝数定量的一种方法。数字PCR数字PCR专业服务
数字PCR技术的原理非常简单,然而在样品分散(divide)的环节上却遇到了无法突破的瓶颈。早期的dPCR尝试使用96孔板到384孔板甚至1536孔板作为分散反应的载体,或者采用类似流式技术的磁珠乳液扩增方法(BEAMing-Beads, Emulsion, Amplification, Magnetics),2006年 Fluidigm公司推出了***台商品化的基于芯片的商品化数字PCR系统。2008年德国 Inostics 推出基于磁珠法乳浊液扩增和流式检测方式的BEAMing dPCR 检测服务,但这些方法无论在分散程度和数据群体的体量上都无法达到更加精细的要求,时间和耗材成本严重限制了dPCR技术的发展。四川准确数字PCR提取外泌体也是个非常费时费钱的事情。
肺*的EGFR突变检测:EGFR突变目前已成为非小细胞肺*(Non-Small-Cell Lung Cancer,NSCLC)患者常规的伴随诊断,对于EGFR酪氨酸激酶抑制剂(TKI)的使用具有重要的指导作用。然而,由于多数NSCLC都处于晚期,很难取到足够的**组织完成该检测,不方便对患者的疗效和耐药情况进行动态监测。相反,血液、胸水以及脑脊液之类的体液标本中会含有**来源的DNA(Circulating tumor DNA,ctDNA),它们更容易获取,被认为是组织标本的有效替代品。由于体液标本中ctDNA的含量非常低,因此对检测方法提出了很高的要求。近年来,有研究者证实,数字PCR的检测敏感性可以低至0.04%,EGFR突变的血浆检测与组织学检测能够有很好的吻合性,相比于传统的检测方法,数字PCR可以***提高血浆中EGFR突变的检出率。此外,利用数字PCR***定量的优势,可以对血浆中EGFR突变的丰度进行动态监测,这种动态变化与患者使用TKI的疗效密切相关,可以更好的指导患者的***。随着越来越多循证医学证据的出现,NSCLC的血液EGFR突变检测正在成为ddPCR相当有前景的应用方向。
传统 PCR 或定量 PCR 反应都是在96/384孔板中进行的,因此早期的数字PCR技术也采用 96 /384孔板作为反应单元。但是数字PCR技术的灵敏度取决于反应单元的总数n,因此,理论上反应单元数越多越有利于提高灵敏度和准确度,普通的96 /384孔板无法满足检测的需要。而且,在96 /384 孔板中进行的PCR反应体系通常大于5μl,由试剂消耗引起的高成本问题令人望而却步。针对上述问题, Morrison 等在25mm×75mm不锈钢芯片上刻蚀了3072个直径为300μm的微反应室(如图2a所示),每个反应单元的体积降低至33 nl。该芯片可在商品化 PCR 仪上使用,与384 孔板的检测灵敏度相当,但反应体积降低为原来的1/64,样品通量提高了24倍。随着反应单元数目的成倍增加,反应体积从微升级降至纳升级,传统的操作人员采用移液器加试样的方式已经无法满足快速精细取样的要求,因此需要借助高通量自动点样仪或机械手等设备,这无疑大幅提高了系统的成本和操作的复杂性。肺*T790M突变-cfDNA动态监测。
数字PCR (Digital PCR) 技术作为新一代核酸检测和***定量技术,目前在痕量核酸样本检测、复杂样本稀有突变检测和微小表达差异鉴定等方面表现出的优势已被普遍认可。NGS和CRISPR等分子生物学技术的发展,为数字PCR技术在microRNA研究、基因组拷贝数精细鉴定、致病微生物鉴定、转基因成分鉴定及基因细胞***等诸多领域带来了新的契机。良好的引物探针设计是数字PCR实验获得成功的关键因素之一。这正是众多研究人员选择LNA(锁核酸技术)的原因——LNA修饰的引物和探针采用了成熟可靠的算法设计,获得了全世界科学家的信赖。高精确度、高灵敏度,荧光定量qPCR灵敏度为1%-0.1%,数字化PCR灵敏度可达0.01-0.001%。四川准确数字PCR
在gDNA长度≥20kb或进行拷贝数变异检测实验时,必须对样品进行酶切处理。数字PCR数字PCR专业服务
优势:不依赖Ct值,无需标准曲线,即可实现真正的***定量高精确度、高灵敏度,荧光定量qPCR灵敏度为1%-0.1%,数字化PCR灵敏度可达0.01-0.001%。对干扰分子(背景信号、PCR抑制剂等)耐受度高,通过信号的“有”“无”定量而不是Ct值。数字PCR研究基因表达遇到基因丰度非常低的,或者样本浓度低的,可以选择数字化PCR,通常CT值大于30的时候,荧光定量qPCR的精确度和重复性会**降低,这个时候可考虑数字化PCR。外泌体里面的micRNA含量是非常低的,提取外泌体也是个非常费时费钱的事情,千辛万苦提取出来的样本,保险起见,用数字化PCR是非常不错的一个选择,而且也非常便宜。数字PCR数字PCR专业服务