山东焦磷酸测序DNA甲基化经验丰富

时间:2021年08月18日 来源:

甲基化DNA免疫沉淀测序(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,MeDIP-Seq)是通过5mC特异性抗体富集甲基化的DN**段,然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量,快速、高效地寻找甲基化区域。可广泛应用于甲基化与疾病关系研究。样本要求:基因组DNA:>=3ug;样品浓度>50ng/ul;无RNA和蛋白污染,建库测序:测序策略:IlluminaHiSeq,PE150;测序深度:20-30Mreads。信息分析:基于全基因组范围的羟甲基化分析,数据质控,Peak锋Calling,Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布,多样本羟甲基化差异聚类,差异羟甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析,结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。850K芯片为半金标准,价格低,分析简单,较为适合EWAS类型的课题。山东焦磷酸测序DNA甲基化经验丰富

DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基供体,将活性甲基转移至DNA链中特定碱基上的化学修饰过程。哺乳动物基因组中,DNA甲基化多发生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一种表观(epigenetic)修饰,它在不改变DNA序列的情况下,对个体的生长、发育、基因表达模式以及基因组的稳定性起到重要的调控作用,并且这种修饰在发育和细胞增殖的过程中是可以稳定传递的。近年来的大量研究表明,DNA异常甲基化与**的发生、发展、细胞*变有着密切的联系。安徽hMeDIP-SeqDNA甲基化服务全基因组甲基化测序是将重亚硫酸盐Bisulfite处理和高通量测序技术相结合。

WGBS:科学方案设计:从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计及时高效的沟通;以保障高质量研究成果。样本要求:基因组DNA:>=3ug;样品浓度>30ng/ul;无RNA和蛋白污染建库测序:测序策略:IlluminaHiSeq,PE150;测序深度:>=30X。信息分析:基于全基因组范围的甲基化分析,数据质控,5mCCalling,5mC在基因组、染色体、功能元件上的分布,多样本甲基化差异聚类,差异甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析,结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。

miRNA的超甲基化:**细胞另一个重要的特点是miRNA表达水平的整体下降,通常也是由于miRNA启动子区域高甲基化造成的。这种miRNA表达失活不仅与**的发***展有关,而且与**的转移密切相关。如**细胞中miR-148a、miR-34b/c、miR-9这三种miRNA都发生了明显得超甲基化,同时外源表达这三种miRNA均可抑制**细胞的生长和转移。**发生是一个涉及多基因、多步骤的复杂过程,越来越多的研究表明DNA甲基化在**的发生、发展、转移中起到了重要的作用,特征性甲基化位点对于**的诊断、分型、预后及***具有重要意义。高通量BSP测序结果多种展示形式。

焦磷酸测序样品要求:·样品类型细胞、新鲜组织或DNA样品·样品量细胞样品请提供至少1×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片,DNA样品请提供1μg以上的DNA·样品质量基因组DNA无明显降解,主带清晰,大于23Kb,无明显弥散。OD260/280值在1.8~2.0之间,浓度≥50ng/μl·样品保存细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可液氮冻存后,-80℃保存。DNA样品可溶于乙醇或超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融·样品运输样品置于1.5ml冻存管中,封口膜封好,干冰运输。焦磷酸测序能提供杂合子缺失及细菌和病毒分型等技术服务。北京WGBSDNA甲基化服务

云生物提供测序服务。山东焦磷酸测序DNA甲基化经验丰富

DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基供体,将活性甲基转移至DNA链中特定碱基上的化学修饰过程。哺乳动物基因组中,DNA甲基化多发生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一种表观(epigenetic)修饰,它在不改变DNA序列的情况下,对个体的生长、发育、基因表达模式以及基因组的稳定性起到重要的调控作用,这种修饰是可逆的,并且这种修饰在发育和细胞增殖的过程中是可以稳定传递的。近年来的大量研究表明,DNA异常甲基化与**的发生、发展、细胞*变有着密切的联系。山东焦磷酸测序DNA甲基化经验丰富

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