山东RiboCop细菌核糖体去除试剂盒Lexogen试剂盒
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SLAMseq代谢标记试剂盒:产品应用:测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。 广东磁珠纯化Lexogen试剂盒哪家好对于不同的需求我们选择不同的Lexogen试剂盒系列。
Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。
Globin mRNA Block模块:
使用Globin Block在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物学及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。Globin mRNAs(HBA1, HBA2, HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因的检测和定量的灵敏度。其他Globin RNA的去除方法需要对RNA进行前处理,需要高起始量的RNA,额外增加成本。
Globin Block可降低Globin RNA Mapped Reads至0.7%:使用Globin Block模块的文库比标准Quantseq文库***降低了总Globin RNA mapped read百分比。在白膜层样品和全血中,使用Globin Block模块可使总Globin RNA mapped read百分比分别低至0.7%和9.7%。
QuantSeq 自动化:Lexogen可提供QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建流程的自动化版本。在自动化平台上构建Illumina兼容的 3’mRNA-Seq文库,能够提供9,216个i5 / i7 index组合,能实现高通量、大规模基因表达检测。自动化减少了手动操作的时间,提高通量,避免手动操作误差和样本错乱。
自动化 QuantSeq 数据分析:Bluebee Genomics Platform**为QuantSeq 3’ mRNASeq文库构建试剂盒(FWD和REV)的数据提供分析。Lexogen为每个试剂盒提供一个密码,使用者可以登录该平台分析数据。也可用Partek Flow (license required)平台进行数据分析。
Lexogen试剂盒的各种系列应用领域还是不一样的。
QuantSeq Data Analysis:
63.02 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-2 GB2 GB
63.06SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-6 GB6 GB
63.12SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-12 GB12 GB
63.25SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-25 GB25 GB
090.24QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24 runs24
091.24QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24
093.03QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
093.06QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB
094.03QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
094.06QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB 云生物销售的Lexogen试剂盒质量怎么样?天津磁珠纯化Lexogen试剂盒哪家好
Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?山东RiboCop细菌核糖体去除试剂盒Lexogen试剂盒
ploy(A)RNA选择试剂盒:LexogenPoly(A)RNA选择试剂盒可以快速、高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA,从而有效地去除通常不太感兴趣的高丰度细胞质核糖体RNA(rRNA)。适用于各种RNA分析需求,例如RNA-seq。产品优势:高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA(>97%蛋白编码RNA);灵活的RNA投入量(500ng-100μg的总RNA投入量);对于CORALL,input量可以低至1ng-1μg;Poly(A)RNA纯化比较高可达500μg(100x5μg)或1,000μg总RNA(10x100μg);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;快速—手动操作时间只需20min;洗脱的或与磁珠结合的Poly(A)RNA可与下游各种应用无缝衔接。工作流程:总RNA变性后,mRNA3'端的poly(A)会与磁珠上的oligo(dT)进行杂交。通过清洗,将没有poly(A)结构的RNA(例如rRNA、tRNA)去除掉。从磁珠上洗脱下来的mRNA(含polyA结构)可用于下游的各种应用,例如cDNA文库构建,RT-PCR,以及总RNA-seq。同样,结合在磁珠上的mRNA也可以直接用于下游的应用(如一链的合成)。Poly(A)RNA选择试剂盒可以与CORALLTotalRNA-Seq文库构建试剂盒结合使用。性能表现:Poly(A)RNA选择试剂盒可以高效特异的对含poly(A)RNA进行富集。 山东RiboCop细菌核糖体去除试剂盒Lexogen试剂盒