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时间:2021年07月13日 来源:

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 云生物专业致力于Lexogen试剂盒生产。北京Lexogen i7 6 nt Index SetLexogen试剂盒代理

QuantSeq Data Analysis:

63.02   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-2 GB2 GB

63.06   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-6 GB6 GB

63.12   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-12 GB12 GB

63.25   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-25 GB25 GB

090.24  QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24   runs24

091.24 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24

093.03 QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

093.06 QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB

094.03 QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

094.06 QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB 四川Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒销售买Lexogen试剂盒就找云生物!

    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Performance3’端链特异性比对:以FDA提供的测序质控(SEQC)标准样品A和B为样本(A和B分别是ERCC外源RNA与有参RNA的混合物1和混合物2)1,2,用QuantSeq试剂盒进行文库构建,测序数据与近期生物分子资源设施协会(ABRF)发布的NGS研究中的mRNA-Seq数据组比对3。在标准mRNA-Seq中,测序Reads覆盖转录本的全长,而QuantSeq的Reads*覆盖转录本的3’端()。在该例子QuantSeq在精确的检测基因表达水平的同时,节省了大于90%的测序深度。由于spike-in转录本*来源于正义链的转录,因此链特异性的评估可以不依赖于于任何基因组注释。在各种情况下均显示出高于,而两个被评估的mRNA-SeqSEQC数据集(datasets)链特异性*分别为。QuantSeq可降低噪音,能够实现准确检测及定量反义转录本。QuantSeq量化范围宽--6个数量级:为了分析QuantSeq的基因计算准确性,用ERCC的spi-ke-in转录本覆盖reads数与input的分子数作图进行分析()。在线性模型评估和Spearman关联性评估中,QuantSeq展现出了非常高的input-output关联性和基因表达测定的准确性。

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品SIRV-Sets三套SIRV,每一套含有不同的SIRVMix或者Mix组合,满足不用的用途()。Table1|SIRV选择指南。SIRV-Set1(货号)包含Isoform模块的MixesE0、E1和E2;SIRV-Set2(货号and)*含IsoformMixE0;而SIRV-Set3(货号)包含SIRVIsoformMixE0和ERCCs.✔:**可用,:**不可用,部分可用(部分Set可用)。SIRV-Set1:SIRV-Set1含有3种不同的“isoform模块”:E0、E1和E2,每种混合物含有所有69种SIRVisoform转录本(来自7个SIRV基因),但浓度比例不同。在特定的RNA测序工作流程下,E0是评估isoform检测能力的理想选择,因为所有69种转录本都以等摩尔浓度存在,它们不作为测序深度的评估选择。E1中包含中等浓度的给定基因的各种转录本;E2**了一种自然的状态,1个基因的一种转录本占主要丰度(转录本可达17种isoform),其他低表达量的转录本小于1%。E2不*可以校正短读长的转录本检测,而且还可以对长读长或者限制读长的测序平台进行线性和灵敏度评测。 云生物销售的Lexogen试剂盒拥有完善的售后服务。

PCR Add-on Kit for Ion Torrent:PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix,PCR Mix中包括Ion Torrent特异性引物和热稳定聚合酶。使用PCR Add-on试剂盒,可以做更多的PCR来确定合适的循环数,防止文库不足或过量。如果样品PCR循环数不够(文库量不够),则该试剂盒可用于增加PCR循环数,重新放大文库。

021.96PCR Add-on Kit for Ion Torrent, 96 rxn96

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021.96PCR Add-on Kit for Ion Torrent, 96 rxn96 Lexogen试剂盒的主要特点都有哪些呢?江苏QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒活动

Lexogen试剂盒的好处有很多。北京Lexogen i7 6 nt Index SetLexogen试剂盒代理

Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096):96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台),可用于QuantSeq,和 CORALL试剂盒。

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