天津Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒多少钱

时间:2021年07月03日 来源:

    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Quantseq在低质量RNA中的表现Quantseq在高质量和低质量(FFPE)样本中有很好的相关性:用同一来源的不同质量RNA样本进行比较,评估Quantseq适用于高度降解的样本(如FFPE样本)的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份,一份进行新鲜冷冻,一份处理成FFPE样本,从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值(RNA完整度)来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本,RIN值不适用于质量的评估,因此使用DV200值(大于200nt的RN**段的分布值)来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后,FFPE样本的DV200值为87%(RIN值),冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA,用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA,即使DV200值低至23%(数据未显示)仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程,对应冷冻样本,应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高(R²=),表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。 云生物专业致力于Lexogen试剂盒的销售。天津Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒多少钱

PCR Add-on Kit for Illumina:用于Illumina平台的PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix、酶Mix和兼容的P7引 物,用于qPCR分析确定PCR的循环数。还包括再扩增引物,其可用于再扩增 Single-index(i7)文库。该Add-on Kit与QuantSeq及CORALL文库制备试剂盒兼容。

020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96

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    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒QuantSeq-Pool与Quantseq结果高度一致。QuantSeq-Pool可获得与Quantseq一致的结果,两者有良好相关性,且重复性好。轻微的差异主要体现在mt转录本上,这主要是由于Quantseqpool和Quangtseq操作流程上的差异导致,如对于低input,10ng的RNAinput量,Quantseq需要使用低input的操作流程。QuantSeq-Pool结合了样本barcode标记和早期pooling与3'mRNASeq的优点,是一种节省时间、测序数据量和数据分析工作的基因表达谱分析方法。这意味着与传统的mRNA-Seq项目相比,总成本降低了10倍。input量通常可以低至10ng总RNA,内置的UMIs可以消除PCR带来的偏好性,从而实现高度可信、稳定的基因表达分析。便捷的操作流程可以手动进行高通量量处理样本,而且对于需要大规模混样测序的项目也可用自动化操作流程。

    SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAMseq试剂盒从S4U标记条件的优化到进行S4U标记动力学实验,以及后续的RNA提取和烷基化,SLAMseq试剂盒为RNA代谢测序实验提供了一个完整的解决方案。产品应用:测定RNA合成及降解速率用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析,测定整个转录组的RNA周转率。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。 云生物的Lexogen试剂盒产品种类繁多。

Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096):96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台),可用于QuantSeq,和 CORALL试剂盒。

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Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096):96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台),可用于QuantSeq,和 CORALL试剂盒。 Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?广东Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒报价

云生物就带您了解一下Lexogen试剂盒的特点。天津Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒多少钱

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 天津Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒多少钱

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