上海代谢标记Lexogen试剂盒多少钱

RiboCop细菌核糖体去除试剂盒：良好的重现性和无脱靶效应：RiboCop表现出极好的稳定性的和重复性。相关图显示了不同重复之间极好的重现性。额外显示未经处理的与ribo-depleted样本转录本丰度之间有高度的相关性：不同的input范围，以及跨越不同物种。表明RiboCop去除细菌rRNA不会产生脱靶效应。RiboCop表现出极好的重现性。以10ng总RNA为input量的两个**实验结果表现出很好的一致性。总RNA分别用RiboCop革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌rRNA去除试剂盒处理。那么Lexogen试剂盒的优势都有哪些呢？上海代谢标记Lexogen试剂盒多少钱

RiboCop细菌核糖体去除试剂盒：RNA input范围宽、性能表现优异、转录组丰度无偏差：核糖体RNA占到细菌转录本的98%。有效去除rRNA可以大幅降低测序成本，并实现对细菌转录组的***分析。为展示RiboCop 细菌核糖体RNA 去除试剂盒的性能，用RiboCop 革兰氏阴性rRNA去除试剂盒对E. coli 的总RNA进行rRNA去除处理(input：1 ng - 1 μg)。对于所有测试input量，RiboCop有效地将rRNA reads数从98%降低到1- 3%，同时维持转录组丰度的无偏差，无脱靶效应。上海代谢标记Lexogen试剂盒多少钱云生物主营Lexogen试剂盒。

ploy(A)RNA选择试剂盒：LexogenPoly（A）RNA选择试剂盒可以快速、高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA，从而有效地去除通常不太感兴趣的高丰度细胞质核糖体RNA（rRNA）。适用于各种RNA分析需求，例如RNA-seq。产品优势：高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA(>97%蛋白编码RNA)；灵活的RNA投入量(500ng-100μg的总RNA投入量)；对于CORALL，input量可以低至1ng-1μg；Poly（A）RNA纯化比较高可达500μg（100x5μg）或1,000μg总RNA（10x100μg）；自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程；快速—手动操作时间只需20min；洗脱的或与磁珠结合的Poly（A）RNA可与下游各种应用无缝衔接。工作流程：总RNA变性后，mRNA3'端的poly(A)会与磁珠上的oligo（dT）进行杂交。通过清洗，将没有poly(A)结构的RNA（例如rRNA、tRNA）去除掉。从磁珠上洗脱下来的mRNA（含polyA结构）可用于下游的各种应用，例如cDNA文库构建，RT-PCR，以及总RNA-seq。同样，结合在磁珠上的mRNA也可以直接用于下游的应用（如一链的合成）。Poly(A)RNA选择试剂盒可以与CORALLTotalRNA-Seq文库构建试剂盒结合使用。性能表现：Poly(A)RNA选择试剂盒可以高效特异的对含poly(A)RNA进行富集。

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品：SIRV-Sets三套SIRV，每一套含有不同的SIRVMix或者Mix组合，满足不用的用途（）。Table1|SIRV选择指南。SIRV-Set1(货号)包含Isoform模块的MixesE0、E1和E2；SIRV-Set2(货号and)*含IsoformMixE0；而SIRV-Set3(货号)包含SIRVIsoformMixE0和ERCCs.✔:**可用,:**不可用，部分可用（部分Set可用）。SIRV-Set1：SIRV-Set1含有3种不同的“isoform模块”：E0、E1和E2，每种混合物含有所有69种SIRVisoform转录本(来自7个SIRV基因)，但浓度比例不同。在特定的RNA测序工作流程下，E0是评估isoform检测能力的理想选择，因为所有69种转录本都以等摩尔浓度存在，它们不作为测序深度的评估选择。E1中包含中等浓度的给定基因的各种转录本；E2**了一种自然的状态，1个基因的一种转录本占主要丰度(转录本可达17种isoform)，其他低表达量的转录本小于1%。E2不*可以校正短读长的转录本检测，而且还可以对长读长或者限制读长的测序平台进行线性和灵敏度评测。 Lexogen试剂盒的系列有很多种。

Globin mRNA Block模块：

使用Globin Block在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤：对于生物学及疾病相关研究，血液是一种信息量大且易于获得的样本。Globin mRNAs(HBA1, HBA2, HBB)占血液总RNA的50-80%，严重影响了基因的检测和定量的灵敏度。其他Globin RNA的去除方法需要对RNA进行前处理，需要高起始量的RNA，额外增加成本。

Globin Block可降低Globin RNA Mapped Reads至0.7%：使用Globin Block模块的文库比标准Quantseq文库***降低了总Globin RNA mapped read百分比。在白膜层样品和全血中，使用Globin Block模块可使总Globin RNA mapped read百分比分别低至0.7%和9.7%。

QuantSeq 自动化：Lexogen可提供QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建流程的自动化版本。在自动化平台上构建Illumina兼容的 3’mRNA-Seq文库，能够提供9,216个i5 / i7 index组合，能实现高通量、大规模基因表达检测。自动化减少了手动操作的时间，提高通量，避免手动操作误差和样本错乱。

自动化 QuantSeq 数据分析：Bluebee Genomics Platform**为QuantSeq 3’ mRNASeq文库构建试剂盒(FWD和REV)的数据提供分析。Lexogen为每个试剂盒提供一个密码，使用者可以登录该平台分析数据。也可用Partek Flow (license required)平台进行数据分析。

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Lexogen试剂盒的优缺点您知道吗？上海代谢标记Lexogen试剂盒多少钱

    Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时，RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在，在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因，且每个基因只少有1个read；相应的，在FFPE样本中能检测到15,190个，两者有24%的差异()。但是，当阈值提高到5或者10个reads/基因时，差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异，是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录，每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本，但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此，相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程，Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 上海代谢标记Lexogen试剂盒多少钱