四川QuantSeq-Flex链合成模块Lexogen试剂盒销售

时间:2021年06月10日 来源:

    RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:Lexogen的RiboCop细菌核糖体RNA去除试剂盒基于磁珠捕获(无酶促反应),自动化友好的工作流程去除细菌总RNA中的rRNA。RiboCopinput范围宽泛(1ng-1μg),适用于完整的及降解的RNA。针对革兰氏阴性、革兰氏阳性和混合细菌种类进行优化的探针设计以确保转录组结果的无偏差(无脱靶效应),同时有效地去除23S、16S和5SrRNA。细菌中rRNA的含量可高达98%,对于细菌转录组分析来说具有一定的挑战性,特别是在分析复杂细菌群落的转录组时,难度更大。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒可有效地从混合细菌样品或单一菌株中去除23S、16S和5SrRNA。兼容完整的以及降解的RNA样本,工作流程简单、高效。rRNA去除后的RNA样品适用于NGS文库的制备及类似的应用,为细菌转录组组成提供一个***的分析方案。RiboCop通过杂交捕获去除不需要的rRNA:RiboCop采用一套亲和探针,可从完整的及降解的RNA中特异和高效地去除rRNA序列。Lexogen精密的探针设计**限度地减少了可能导致NGS数据发生偏差的脱靶效应。Input量可低至1ng,高至1μg的总RNA,取决于样品组成和使用的产品类型。rRNA去除试剂盒中**的探针池可用于革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌。 上海Lexogen试剂盒代理哪家好?四川QuantSeq-Flex链合成模块Lexogen试剂盒销售

    SPLITRNA提取试剂盒:SPLITRNA提取试剂盒是专门为需要RNA纯化的下游应用特别设计的,如RNA-Seq。它可快速高效的提取出DNA-free的RNA。更重要的,SPLIT无需DNase处理(DNase可能会对RNA造成损害)。SPLITRNA提取试剂盒既可以回收总RNA,还可以分别提取大片段的RNA和小片段的RNA。产品优势:可提取从17nt到大于10,000nt的TotalRNA;可以选择性的提取大片段或者小片段的RNA(Cut-off值在150nt左右);*需要30分钟;很高的RNA完整性和纯度(组织:RIN>8,细胞培养物:RIN10);试验过程无需DNase处理,且保证RNA中无基因组DNA;**的提取效率(低投入量,低至);本试剂盒可用于FFPE样本(样本需经过脱蜡处理);NEW!SPLITforblood试剂盒可去除人血液样本中的GlobinmRNAs。工作流程:SPLITRNA提取试剂盒可以简单、快捷、可靠地从不同物种(如哺乳动物、植物、昆虫、***和细菌)的多种材料(血浆、组织、细胞系)中提取RNA。样品在高盐提取缓冲液下匀浆,既可使RNase失活,又能提高样品的裂解。用酸性的酚-氯仿法抽提RNA,并辅以锁相凝胶管,将含RNA的水相与有机相(含DNA和蛋白质)清晰的分离开来。紧接着将RNA组分用硅胶柱纯化回收,既可回收总RNA,也可回收大片段或/和小片段RNA。 北京QuantSeq Data AnalysisLexogen试剂盒要多少钱云生物专业致力于Lexogen试剂盒维修。

    Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。

QuantSeq-Flex第二链合成模块 V2:QuantSeq-Flex第二链合成模块V2,在QuantSeq操作流程中随机的第二链合成引物可以被靶向特异性引物取代。*适用于QuantSeq FWD试剂盒(货号 015)。

货号、产品描述和规格如下:028.96QuanSeq-Flex Second Strand Symthesis Module for Illumina,96 preps96

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    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 云生物Lexogen试剂盒的售后服务很好。北京QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒销售

Lexogen试剂盒的不同系列会有不同的优势。四川QuantSeq-Flex链合成模块Lexogen试剂盒销售

QuantSeq FWD UMI第二连合成模块(Illumina, Read 1):UMI模块含6个碱基长的**分子标签(UMIs)对单个转录本进行**标记,在Read 1开始的时候就读出来。模块中包含UMI第二链合成Mix(USS),代替了QuantSeq FWD试剂盒中的第二链合成Mix1(SS1)(注意:此模块与 QuantSeq REV不兼容)。Bluebee Genomics平台可为QuantSeq UMI提供数据分析。

货号、产品描述和规格信息:081.96UMI Second Strand Synthesis Module for QuantSeq FWD (Illumina, Read 1), 96 rxn96


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