山东表达谱文库构建Lexogen试剂盒销售厂家

时间:2021年04月27日 来源:

Globin mRNA Block模块:

使用Globin Block在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物学及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。Globin mRNAs(HBA1, HBA2, HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因的检测和定量的灵敏度。其他Globin RNA的去除方法需要对RNA进行前处理,需要高起始量的RNA,额外增加成本。

Globin Block可降低Globin RNA Mapped Reads至0.7%:使用Globin Block模块的文库比标准Quantseq文库***降低了总Globin RNA mapped read百分比。在白膜层样品和全血中,使用Globin Block模块可使总Globin RNA mapped read百分比分别低至0.7%和9.7%。

QuantSeq 自动化:Lexogen可提供QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建流程的自动化版本。在自动化平台上构建Illumina兼容的 3’mRNA-Seq文库,能够提供9,216个i5 / i7 index组合,能实现高通量、大规模基因表达检测。自动化减少了手动操作的时间,提高通量,避免手动操作误差和样本错乱。

自动化 QuantSeq 数据分析:Bluebee Genomics Platform**为QuantSeq 3’ mRNASeq文库构建试剂盒(FWD和REV)的数据提供分析。Lexogen为每个试剂盒提供一个密码,使用者可以登录该平台分析数据。也可用Partek Flow (license required)平台进行数据分析。


Lexogen试剂盒多种系列供您选择。山东表达谱文库构建Lexogen试剂盒销售厂家

    TraPR功能性小RNA提取试剂盒:小RNA是基因表达的重要调控因子,并参与各种调控通路,如**、炎症和发育。此外,sRNAs可以作为疾病检测或监测的生物标记物,也可以作为药物靶点。这些sRNAs与Argonaute家族(AGOs)的特定蛋白结合,形成RNA诱导的沉默复合体(RISCs),并引导AGO蛋白到达各自的靶点。目前特异性分离功能性sRNAs主要是通过免疫共沉淀(Co-IP)的方式。Co-IP是一种非常特异且灵敏的方法用于分离功能性sRNAs,但它有很大的局限性,**于一种感兴趣的生物体,需要昂贵且可用的抗体。另外,用商业化的sRNA提取试剂盒(膜柱法)对sRNA进行分离是一种比较快速、简单和廉价的方式,但特异性差,因为所有小于200nt的RNA都会被纯化。因此,RNAseq的大部分reads将被浪费在RNA降解产生的非功能性RN**段上。后者可通过繁琐的切胶回收等步骤来提高特异性,但是切胶回收仍然纯粹是基于片段的大小选择,因此不能区分功能性sRNAs和降解RN**段。迄今为止,还没有将AGOCo-IP的特异性与简单的商业化sRNA提取试剂盒相结合的方法。 广东磁珠纯化模块Lexogen试剂盒根据您的具体需求选择不同的Lexogen试剂盒系列。

    SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。

QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2:QuantSeq-FlexRNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行**链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。产品优势:试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;>100多重引物的靶向文库构建;每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;识别已知和未知融合转录本;只需;节省测序成本,Dualindex兼容多达9,216种组合(i5/i7组合)。工作流程:使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:1)Oligo(dT)用于**链合成,随机引物用于第二链合成(QuantseqFWD);2)Oligo(dT)用**链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’mRNA-Seq);3)特异性靶向引物用于**链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);4)特异性靶向引物用于**链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。 Lexogen试剂盒批发就找云生物。

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒QuantSeq-Pool加快基因表达项目研究。LexogenQuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3'mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。通量灵活,适用于大规模的通量项目。在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDIindex,以获得更高的通量。稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度。高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100K至1M。这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。 云生物专业Lexogen试剂盒厂家。上海TeloPrime PCR Add-on Kit V2Lexogen试剂盒销售厂家

云生物销售的Lexogen试剂盒质量怎么样?山东表达谱文库构建Lexogen试剂盒销售厂家

    Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 山东表达谱文库构建Lexogen试剂盒销售厂家

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