广东Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

时间:2021年04月26日 来源:

    Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 Lexogen试剂盒的主要特点有很多。广东Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 陕西Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒代理Lexogen试剂盒批发就找云生物。

Lexogen i5 6 nt UDI Add-on Kits (5001-5096):Lexogen 6碱基i5双Index Add-on试剂盒提供4个(5001-5004)或96个(5001-5096) Unique i5 index,与QuantSeq和CORALL Library Prep Kits兼容。96个 i5和96个i7 Indix结合使用,可实现多达9,216种不同的i5 / i7 index组合,从而 实现完全灵活的双端**的index。

货号产品描述规格047.4x24Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 24 rxn/Index4x24

047.4x96Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 96 rxn/Index4x96

047.96Lexogen i5 6 nt Unique Dual Indexing Add-on Kit (5001-5096), 1rx/Index96

PCR Add-on Kit for Illumina:用于Illumina平台的PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix、酶Mix和兼容的P7引 物,用于qPCR分析确定PCR的循环数。还包括再扩增引物,其可用于再扩增 Single-index(i7)文库。该Add-on Kit与QuantSeq及CORALL文库制备试剂盒兼容。

020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96

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020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96 云生物Lexogen试剂盒拥有完善的售后。

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒QuantSeq-Pool与Quantseq结果高度一致。QuantSeq-Pool可获得与Quantseq一致的结果,两者有良好相关性,且重复性好。轻微的差异主要体现在mt转录本上,这主要是由于Quantseqpool和Quangtseq操作流程上的差异导致,如对于低input,10ng的RNAinput量,Quantseq需要使用低input的操作流程。QuantSeq-Pool结合了样本barcode标记和早期pooling与3'mRNASeq的优点,是一种节省时间、测序数据量和数据分析工作的基因表达谱分析方法。这意味着与传统的mRNA-Seq项目相比,总成本降低了10倍。input量通常可以低至10ng总RNA,内置的UMIs可以消除PCR带来的偏好性,从而实现高度可信、稳定的基因表达分析。便捷的操作流程可以手动进行高通量量处理样本,而且对于需要大规模混样测序的项目也可用自动化操作流程。 Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?天津ployARNA选择Lexogen试剂盒代理价格

云生物主营Lexogen试剂盒。广东Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:QuantSeq3'mRNA-seq文库构建试剂盒是以mRNA靠近3'端序列进行文库构建,文库可兼容Illumina和IonTorrent测序平台。每个转录组本只产生一个片段,因此能准确进行基因表达定量,同时减少测序深度,能使更多样本混样测序。

产品优势:快速简单的一体化实验方案:从总RNA到可用于测序的文库时间不超过;每个转录本*有一个片段产生—可进行全基因组范围的基因表达分析;能稳定、灵敏检测低丰度的转录本;适用于低起始量(100pg(FWD)或10ng(REV)总RNA)及低质量RNA(如FFPE样本);可高效替代芯片检测或传统的RNA测序,友好匹配自动化工作站;在Blubee基因组分析平台上**进行数据分析;NEW!节约成本,优化的globinmRNA去除流程可用于QuantSeq文库构建;Dualindexes能支持9,216个i5/i7index,或者可选择96个uniqueindex,同时提供能够检测、排除扩增偏好性的UMIs。 广东Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

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