云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

G0F 抗体在 30 分钟内：半乳糖的存在会影响zhiliao性抗体引发的效应功能，为了研究抗体的作用方式，可能需要彻底去除半乳糖残留物。Genovis的GalactEXO Immobilized 的 β1-4 半乳糖苷酶活性在曲妥珠单抗上使用 30 分钟孵育证明。genovis的GalactEXO Immobilized 由强大的 GalactEXO 酶组成，该酶固定在琼脂糖珠上，并以易于使用的微离心柱形式格式化。GalactEXO是β-半乳糖苷酶的混合物，可有效去除N-和O-糖基化蛋白上的半乳糖残基。使用FabRICATOR®将抗体消化成亚基，并使用LC-MS进行分析。使用 GalactEXO 冻干和 GalactEXO 固定化都可以看到向 G0F 糖型的转变，但后者在z终制剂中没有留下酶。没有任何半乳糖基化结构表明半乳糖残基完全水解，因此LC-MS数据中任何剩余的次要峰都可以注释为亚基的糖化。没有任何半乳糖基化结构表明半乳糖残基完全水解，因此LC-MS数据中任何剩余的次要峰都可以注释为亚基的糖化。GalactEXO微离心柱经过格式化，可在30-60分钟内水解0.5mg糖蛋白中的半乳糖。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

我们展示了使用两种蛋白作为底物的OmniGLYZOR的性能。依那西普是一种 Fc 融合蛋白，含有 TNFα 受体的胞外结构域。该结构域用 2 个 N-糖和 8-11 个 1 个具有不同程度唾液酸化的 O-聚糖修饰。在 37°C 下将这种重糖基化蛋白在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可完全去除所有 N-和 O-糖，如中级 LC-MS 分析所示。促红xibao生成素 （EPO） 是一种携带 3 个 N-聚糖和 1 个he心 1 个 O-聚糖的小蛋白质，其总质量的近 40% 由聚糖组成。O-连接聚糖通常存在于蛋白质的暴露位置，因为它们在蛋白质折叠发生后附着。只有负责其合成的糖基转移酶才能接触到这些暴露的位点。甘肃PNGaseF去糖基化酶两种酶都含有 His 标签，酶的分子量为 43 kDa 和 66 kDa。

Fc N-聚糖在抗体的效应功能中起着至关重要的作用，但可能会增加蛋白质表征测定的复杂性。在天然条件下用PNGase F去除Fc N-糖可以表征游离N-糖以及去糖基化抗体的功能和结构。 为了证明PNGase F固定化和PNGase F冻干在天然反应条件下有效去除Fc N-聚糖，对zhiliao性抗体曲妥珠单抗进行了处理。图2中的质量数偏移表明，在37°C下用Genovis的PNGase F冻干或PNGase F固定化孵育1小时后，曲妥珠单抗上的Fc N-聚糖成功去除，与在溶液中用PNGase F冻干处理的样品相比，没有酶干扰用PNGase F固定处理的样品的分析。

从依那西普水解β1-3和β1-4半乳糖：Genovis的GalactEXO Immobilized 对 β1-3 和 β1-4 连接的半乳糖均具有酶活性，这些半乳糖存在于装饰有 N- 和 O-连接糖基化的生物制药中，例如 Fc-融合蛋白依那西普。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟，并在FabRICATOR消化后使用LC-MS在亚基水平上研究酶活性。TNFR和Fc/2片段分别分析。与GalactEXO Immobilized孵育导致N-连接和O-连接聚糖上的半乳糖残基水解，这在半乳糖基化物种中被视为信号丢失。对游离的N-聚糖分析证实了LC-MS数据。GalNAcEXO 酶来源于Akkermansia muciniphila，在大肠杆菌中表达，带有His标签，分子量为52 kDa。

我们测量了FucosEXO从一组dai表不同键的不同寡糖底物中释放的岩藻糖。FucosEXO可有效释放α1-2、α1-3和α1-4连接的岩藻糖，对α1-6连接的岩藻糖残基没有活Genovis的FucosEXO的底物特异性：岩藻糖以不同的键存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖常见于 O-聚糖中，并作为 N-聚糖的天线岩藻糖基化，而 α1-6 连接的岩藻糖被发现是 N-聚糖he心的修饰。β1-3,4半乳糖的水解：Genovis的GalactEXO 是一种β-半乳糖苷酶混合物，可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-连接末端半乳糖。使用FabRICATOR®将曲妥珠单抗消化成亚基，并使用LC-MS进行分析。甘肃PNGaseF去糖基化酶

水解ɑ2-3-连接唾液酸的冻干酶SialEXO 2-3，装在500个单位的小瓶中，用于0.5mg糖蛋白的去唾液酸化。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究

Genovis的ImpaRATOR™ 和 OpeRATOR® - 两种协同的作用：O-糖蛋白酶。使用ImpaRATOR或OpeRATOR消化后分析依那西普重糖基化区域O-聚糖位点的覆盖率（图3）。使用OpeRATOR鉴定对应于所有13个O-聚糖位点的肽，而使用ImpaRATOR只能明确鉴定10个位点。ImpaRATOR 可能比 OpeRATOR （1） 具有更具选择性的氨基酸序列偏好，此处由 S186 和 T245 位点缺乏消化来表明。此外，ImpaRATOR 在两个相邻的 O-糖基化氨基酸之间显示出有限的裂解，如 S213 位点酶解肽的缺乏以及 T200 和 T217 位点酶解肽的低强度所证明的那样。在OpeRATOR酶解样品（T184-S199和T200-H204;图2b和d），而在ImpaRATOR消化的样品中，具有漏裂的相应肽（S184-H204）的强度更高。 虽然OpeRATOR显示出更高的O-聚糖位点覆盖率，但使用ImpaRATOR进行消化可以表征O-聚糖结构，包括唾液酸化物种。例如，条形图插入显示了两种糖肽 T184-V198 和 T205-P207 的 O-聚糖种类。这应该与使用OpeRATOR的消化进行比较，在OpeRATOR中，必须去除唾液酸才能产生酶活性，这意味着有关唾液酸化的信息丢失。总而言之，ImpaRATOR 和 OpeRATOR 酶共同提供了有关聚糖组成和 O-聚糖位点的完整信息。云南高活性/无非特异酶活PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究