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PCR引物设计的原则PCR反应中有两条引物,即5′端引物和3′引物。设计引物时以一条DNA单链为基准(常以信息链为基准),5′端引物与位于待扩增片段5′端上的一小段DNA序列相同;3′端引物与位于待扩增片段3′端的一小段DNA序列互补。(1)引物设计的基本原则引物长度:15-30bp,常用为20bp左右。引物碱基:G+C含量以40-60%为宜,G+C太少扩增效果不佳,G+C过多易出现非特异条带。ATGC比较好随机分布,避免5个以上的嘌呤或嘧啶核苷酸的成串排列参照。引物内部不应出现互补序列。两个引物之间不应存在互补序列,尤其是避免3′端的互补重叠。引物与非特异扩增区的序列的同源性不要超过70%,引物3′末端连续8个碱基在待扩增区以外不能有完全互补序列,否则易导致非特异性扩增。引物3‘端的碱基,特别是较末及倒数第二个碱基,应严格要求配对,比较好选择是G和C。引物的5′端可以修饰。如附加限制酶位点,引入突变位点,用生物素、荧光物质、地高辛标记,加入其它短序列,包括起始密码子、终止密码子等。pcr检测实验成功的诀窍!江苏pcr要多久

PCR反应的比较大特点是具有较大扩增能力与极高的灵敏性,但令人头疼的问题是易污染,极其微量的污染即可造成假阳性的产生。主要原因有:1、标本间交叉污染;2、PCR试剂的污染;3、PCR扩增产物污染;4、实验室中克隆质粒的污染。一个好的实验室,要时刻注意污染的监测,考虑有无污染是什么原因造成的污染,以便采取措施,防止和消除污染。1、阳性对照:在建立PCR反应实验室及一般的检验单位都应设有PCR阳性对照,它是PCR反应是否成功、产物条带位置及大小是否合乎理论要求的一个重要的参考标志。2、阴性对照:每次PCR实验务必做阴性对照。它包括:(1)标本对照:被检的标本是血清就用鉴定后的正常血清作对照;被检的标本是组织细胞就用相应的组织细胞作对照。(2)试剂对照:在PCR试剂中不加模板DNA或RNA,进行PCR扩增,以监测试剂是否污染。3、重复性试验。4、选择不同区域的引物进行PCR扩增。湖北pcr是什么意思有没有做pcr检测比较快比较好的公司?

PCR出现假阳性的原因分析。引物设计不合适:选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性,因而在进行PCR扩增时,扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短,容易出现假阳性。需重新设计引物。靶序列或扩增产物的交叉污染:这种污染有两种原因:一是整个基因组或大片段的交叉污染,导致假阳性。这种假阳性可用以下方法解决:①操作时应小心轻柔,防止将靶序列吸入加样器内或溅出离心管外。②除了酶及其他不耐高温的物质外,所有试剂或器材均应高压消毒。所用离心管均应一次性使用。③必要时,在加标本前,反应管和试剂用紫外线照射,以破坏存在的核酸。二是空气中的小片段核酸污染,这些小片段比靶序列短,但有一定的同源性。可互相拼接,与引物互补后,可扩增出PCR产物,而导致假阳性的产生,可用巢式PCR方法来减轻或消除。
PCR实验技术中的5’RACE-PCR介绍:利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准一号链cDNA.利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到一号链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMART序列为模板继续延伸而连上通用接头(figure2)。然后用一个含有部分接头序列的通用引物UPM(universalprimer,UPM)作为上游引物,用一个基因特异引物2(GSP2genespecificprimer,GSP)作为下游引物,以SMART一号链cDNA为模板,进行PCR循环,把目的基因5‘末端的cDNA的片段扩增出来。比较终,从2个有相互重叠序列的3'/5‘-RACE产物中获得全长cDNA,或者通过分析RACE产物的3‘和5‘端序列,合成相应引物扩增出全长cDNA.英瀚斯生物pcr检测,保证真实实验检测,数据保密完整性。

PCR实验技术中的锚定PCR(AnchoredPCR)介绍:锚定PCR主要用于分析具有可变末端的DNA序列,Loh等用A-PCR对人外周血淋巴细胞T细胞受体α-链的mRNA的多变性进行了分析。先合成cDNA,并用末端脱氧核苷酸转移酶在其3’-可变区末端加上一个PolyG尾巴。Loh等恒定区与可变区连接部位设一个引物,另一个引物是一个具5’-polyG尾巴的引物。带有PolyG尾巴的引物是一个固定点,它可以并与PolyG尾巴结合,无论其余部分序列如何,只识别片段末端,利用此法可从前述mRNA中检出至少20种不同序列,每一种都是独特的,表明A-PCR不对任何特殊序列有倾向性结果,可用于T细胞及其它部位抗体基因的研究。细胞上清提取RNA进行PCR检测。江西pcr价格
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PCR样本可分2种,DNA样本和RNA样本。一,DNA样本:已经提取好的DNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,需全血,加入抗凝剂,抗凝管4度保存;组织样本,需冻存管或干净灭菌的离心管装,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。二,RNA样本:提取好的RNA样本,负80度保存,干冰运输;血液样本,全血,加入抗凝剂,4度冰箱保存;组织样本,冻存管或干净灭菌离心管,负80度保存,干冰运输;细胞样本,用胰酶消化后的细胞沉淀,负20度或负80度保存。长时间保存,可加Trizol,其中血液用TrizolLS组织和细胞沉淀用Trizol。江苏pcr要多久
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