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时间:2023年09月25日 来源:

单颗粒冷冻电镜技术样品的筛选和数据采集:在开始高分辨数据采集前,可以利用冷冻电镜先对样品质量进行评估,包括但不限于蛋白浓度、稳定性和分布,冰层厚度、质量和载网各处的均一性等的检查。用户可以在120kV电镜或200kV电镜上进行此筛样过程。待到样品通过筛选,用户可以利用300kV或200kV电镜采集更大的数据量来帮助开展2D和3D分析。200kV-TalosArctica透射电镜配备了直接电子探测相机FalconIII,在样品质量较高时,较高可以获得<3Å的数据。目前的300kV-TitianKrios透射电镜有两套,其中一台配备了目前行业前列的K3直接电子探测相机,另一台配备有K2相机和能量过滤器,两套电镜均能够进行全自动、长时间无人照看的数据收集操作,可实现样品的大规模数据采集,并获得极高分辨率的结构信息。收集得到数以万计的单颗粒物照片后,用户可以使用平台集群已安装的常用三维重构计算软件以及相关生物软件对数据集进行计算处理。冷冻电子显微技术主要包括单颗粒冷冻电镜技术和冷冻电子断层扫描技术。深圳冷冻电子显微镜技术服务中心

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冷冻电子显微镜技术在20世纪70年代时提出,经过近10年的努力,在80年代趋于成熟,近年来已经进入了快速发展的时期。它的研究对象非常普遍,包括病毒、蛋白、肌丝、蛋白质核昔酸复合体、亚细胞器等。一方面,冷冻电微镜技术所研究的生物样品既可以是具有二维晶体结构的,也可以是非晶体的;而且对于样品的分子量没有限制。因此,很大程度突破了X-射线晶体学只能研究三维晶体样品和核磁共振波谱学只能研究小分子量(小于100KD)样品的限制。另一方面,生物样品是通过快速冷冻的方法进行固定的,克了因化服学固定、染色、金属镀膜等过程对样品构象的影响,更加接近样品的生活状态。武汉冷冻电镜单颗粒技术服务中心冷冻电镜技术中的单颗粒分析法的研究对象可以是具有某种对称性的颗粒,也可不具有任何对称性的蛋白分子。

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冷冻电镜技术是什么呢?冷冻电镜用于生物样品三维结构解析,包含单颗粒分析、微晶电子衍射和冷冻电子断层扫描3种技术。冷冻电镜单颗粒分析技术(cryo-EMSPA)是一种以单颗粒形式分析生物分子组装的新方法,通过将负染电镜筛选获得的合适浓度的生物分子样品快速冷冻,使生物大分子以近天然状态存在于无定形冰中,然后进行冷冻样品的筛选、数据收集和三维结构解析,从而获得高分辨率的生物分子结构。冷冻电镜单颗粒分析技术能够从分子层面进行详细的研究,解析基于结构的药物研发的分子基础,而冷冻电子断层扫描能够从亚细胞水平观察目标分子在原位细胞环境中的作用位点和作用机制,相信在不久的将来能够用于进一步确认基于结构的药物研究的可靠性。微晶电子衍射不只能够进行小分子微晶结构解析,也可与现有技术互补,进行生物大分子及其复合物的微晶结构解析。

冷冻电镜技术的原理:冷冻电子显微学解析生物大分子及细胞结构的中心是透射电镜成像,其基本过程包括样品制备、透射电镜成像、图像处理及结构解析等几个基本步骤。在透射电镜成像中,电子枪产生的电子在高压电场中被加速至亚光速并在高真空的显微镜内部运动,根据高速运动的电子在磁场中发生偏转的原理,透射电镜中的一系列电磁透镜对电子进行汇聚,并对穿透样品过程中与样品发生相互作用的电子进行聚焦成像以及放大,Z后在记录介质上形成样品放大几千倍至几十万倍的图像,利用计算机对这些放大的图像进行处理分析即可获得样品的精细结构。冷冻电镜技术的基本原理利用快速冷冻技术将其瞬间冷冻至液氮温度下。

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单颗粒冷冻电镜技术的颗粒挑选:接下来需要从原始数据中筛选出颗粒投影,也被称为“颗粒挑选”,颗粒挑选的好坏也将影响所有后续的分析和处理过程,是一个重要并且繁琐的步骤。颗粒挑选方式可以分为手动挑选、半自动挑选和完全自动挑选这几种。在早期的分析中,对于结构的了解还非常少,优先考虑的都是人工挑选。但是自动的颗粒图像获取方法的出现使得在很短时间内可以收集数十万张颗粒图像,人工挑选大量的颗粒图像不太现实,并且人工的挑选通常会过于集中于某一类颗粒图像,导致遗漏和偏差。半自动和全自动的方法主要有以下三类:(1)通过例如降噪、反衬增强、边缘算子等图像形态学方法搜索区域,基于数字图像处理学的原理,将颗粒图像与背景分离开来。(2)基于模板的方法,通过扫描数据图像和已知的模板比较来挑选出潜在的颗粒图像,模板的来源通常为手动选出的数据图像中较为清晰的颗粒图像,或者是已知结构的投影。(3)结合无模板和有模板的方法,通过一些有监督的机器学习算法进行颗粒挑选。冷冻电镜技术可以通过揭示细胞里发生的生命过程细节,帮助人们了解很多有意思的生物学现象。黄石冷冻透射电镜技术哪家好

冷冻电镜技术之冷冻蚀刻电子显微镜优点:样品经冷冻断裂蚀刻后,能够观察到不同劈裂面的微细结构。深圳冷冻电子显微镜技术服务中心

冷冻电镜技术究竟是什么呢?一直以来,科学家们不断进行基础生命科学的探究,探究细胞内的生命规律,为人类健康及其他学科提供借鉴。而分子是生命体中行使功能的较小单元,生命科学研究也逐步发展到了微观生物分子的结构与功能研究阶段,以期逐步加深对生命过程的认知。充分的基础研究不只能帮助我们深刻认识生命过程,并且能够帮助改善人类健康和提高人类生活质量。科学家们能够通过生命科学研究帮助确定新的药物靶点,并进行基于靶点的药物筛选,提高药物研究的成功率、安全性和有效性。并且随着生物制品尤其抗体大分子药物的发展,冷冻电镜技术越来越多地应用于活性生物分子结构的解析中。深圳冷冻电子显微镜技术服务中心

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