厦门血液定量PCR研究方案

Real-time PCR链式反应的常见问题：靶序列变异：如靶序列发生突变或缺失，影响引物与模板特异性结合，或因靶序列某段缺失使引物与模板失去互补序列，其PCR扩增是不会成功的。假阳性：出现的PCR扩增条带与目的靶序列条带一致，有时其条带更整齐，亮度更高。引物设计不合适：选择的扩增序列与非目的扩增序列有同源性，因而在进行PCR扩增时，扩增出的PCR产物为非目的性的序列。靶序列太短或引物太短，容易出现假阳性。需重新设计引物。出现片状拖带或涂抹带：PCR扩增有时出现涂抹带或片状带或地毯样带。其原因往往由于酶量过多或酶的质量差，dNTP浓度过高，Mg2+浓度过高，退火温度过低，循环次数过多引起。其对策有：减少酶量，或调换另一来源的酶。②减少dNTP的浓度。适当降低Mg2+浓度。增加模板量，减少循环次数。聚合酶链式反应准备：PCR所用的酶主要有两种来源：Taq和Pfu，分别来自两种不同的噬热菌。实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。厦门血液定量PCR研究方案

Real-time PCR操作流程：1、收集样品。2相关试剂总RNA提取试剂TREzolReagent(RNA提取试剂),M-MLV（cDNA逆转录酶）,RNA纯化试剂,RealqPCRMasterMix（萤光定量PCR预混试剂）。3实验仪器萤光定量PCR仪;PCR仪；低温离心机。4总RNA提取。5cDNA合成在0.5ml的离心管中加入1µl模板总RNA（1µg/µl）；Real-time PCR操作流程：2µl随机引物（T18,10pmol/ul）；2µl10mMdNTPmix；加水至15µl体系。混匀后70℃变性RNA5分钟，冰上速冷1分钟，离心将溶液收集至管底加入6µl5×PCRbuffer；1µlRNaseout；1µlM-MLVRT；加水至30µl体系。PCR仪中反应条件设定37℃延伸60min，70℃保温15min终止反应。合成好的cDNA置于-20℃保存备用。徐州微量RT-PCR检测技术原理及步骤聚合酶链反应是是一种简单，廉价和可靠的方法复制DN段。

Real-time PCR萤光染料掺入法:在PCR反应体系中，加入过量SYBR萤光染料，SYBR萤光染料特异性地掺入DNA双链后，发射萤光信号，而不掺入链中的SYBR染料分子不会发射任何萤光信号，从而保证萤光信号的增加与PCR产物的增加完全同步。此方法适用于：1、灵敏度高：使用SYBR可使萤光效果增强到1000倍以上。2、通用性好,不需要设计探针,方法简便,省时,价格低廉。3、通用型方法，在国内外科研中普遍使用。4、高通量大规模的定量PCR检测。5、专一性要求不高的定量PCR检测。

Real-time PCR链反应的常见问题分析与解决方法：反应缓冲液未完全融化或未充分混匀。确保反应缓冲液融化完全并彻底混匀。引物特异性差。利用BLAST检查引物特异性或重新设计引物。引物量过多。减少反应体系中引物的用量。模板量过多。质粒DNA的用量应<50ng，而基因组DNA则应<200ng。外源DNA污染。确保操作的洁净。阴性对照出现条带：试剂，头，工作台污染。使用全新的试剂和头，对工作台进行清洁。条带大小与理论不符：污染。使用全新的试剂和头，对工作台进行清洁。模板或引物使用错误。更换引物和模板。基因亚型。对研究的基因进行序列分析和BLAST研究。逆转录-聚合酶链反应较广用于表达谱，以确定基因的表达或鉴定RNA转录物的序列。聚合酶链式反应又称多聚酶链式反应。

聚合酶链反应同时扩增单个精子中几个基因座的能力增强了极大地增强了通过研究减数分裂后染色体交叉来进行基因定位的传统任务。通过分析数千个单个精子，已经直接观察到非常紧密基因座之间罕见的交叉事件。类似地，可以分析异常的缺失、插入、易位或倒位，所有这些都无需等待(或支付)漫长而艰苦的受精、胚胎发生等过程。定点突变：聚合酶链反应可用于产生突变基因，突变由科学家随意选择。可以选择这些突变来理解蛋白质是如何完成其功能的，并改变或改善蛋白质功能。聚合酶链式反应的模板的取材主要依据PCR的扩增对象，可以是病原体标本如病毒、细菌、菌类等。Real-time PCR的基本目标是精确测量和鉴别非常微量的特异性核酸。厦门血液定量PCR研究方案

Real-time PCR从用途上分可以分为定性分析和定量分析。厦门血液定量PCR研究方案

引物的设计对于这个实验至关重要，因为Real-time PCR的检测灵敏度比较高，所以相应的对引物设计的要求就很高。普通的要求规则大家都知道，还有几点必须注意：1，引物的错配率（引物错配形成引物二聚体，但是SYBR照样能嵌入进去，结果导致实验结果的误差很大，重复性也不好）。2，引物的特异性一定要高（不像常规PCR，引物同源性不高，只要两条产物的片段长度相差足够大，在电泳的时候能够区分开就可以。Real-time PCR只有在熔解曲线的时候能分开，所以这就造成整个实验结果误差很大，不可信）。厦门血液定量PCR研究方案

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