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时间:2022年02月12日 来源:

industryTemplateWGBS技术及应用是有力方案。北京6mA技术服务经验丰富

    大豆驯化和改良过程中的DNA甲基化足迹(1):128.(IF=)本课题通过WGBS技术比较了野生大豆、地方品种和改良品种(n=45)在大豆驯化与改良过程中DNA甲基化的变化,鉴定了5412个甲基化差异区域(DMR),而这些DMR基因富集在碳水化合物代谢途径。这为大豆不同品种间DNA甲基化提供了有价值的图谱,拓展了大豆驯化与改良的认识。血浆DNA甲基化分析提示EBV病毒相关疾病的病因(1):3256(IF=)本研究通过对鼻咽*(NPC,n=15)、EBV相关性淋巴瘤(n=9)和传染性单核细胞增多症患者(n=5)的血浆游离DNA进行WGBS测序分析,发现EBVDNA甲基化图谱呈现疾病相关模式。这表明在鼻咽*诊断中进行血浆EBVDNA甲基化分析具有重要的潜力。 浙江WGBS技术服务专业服务甲基化验证方案是TBS。

DNA甲基化对基因表达调控起着动态的重要作用。 借助MethylationEPIC BeadChip,研究人员可以基于单核苷酸分辨率定量检测基因组中的850,000多个甲基化位点。包括FFPE在内的多重样本可以并行分析,以便在每样本比较低成本的情况下实现高通量功能。依托业界**的Infinium实验分析方法,MethylationEPIC BeadChip是全表观基因组关联研究(EWAS)的理想之选。它提供了由专家精选的***的覆盖范围,囊括99%的RefSeq基因,95%的CpG岛,高覆盖度的增强子区域和其他内容类别。由于超过90%的Infinium HumanMethylation450K位点内容都涵盖在内,因此新一代MethylationEPIC试剂盒对这些位点也完全支持。

    焦磷酸测序(Pyrosequencing)技术服务基于QIAGEN公司的PyroMarkQ96ID平台,能提供基于序列测定的SNP检测、等位基因频率分析和甲基化检测,杂合子缺失及细菌和病毒分型等技术服务。样品要求·样品类型细胞、新鲜组织或DNA样品·样品量细胞样品请提供至少1×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片,DNA样品请提供1μg以上的DNA·样品质量基因组DNA无明显降解,主带清晰,大于23Kb,无明显弥散。OD260/280值在~,浓度≥50ng/μl·样品保存细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)可液氮冻存后,-80℃保存。DNA样品可溶于乙醇或超纯水中,-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融·样品运输样品置于ml冻存管中,封口膜封好,干冰运输。 细胞、全血、组织样本干冰运输。

Chip-Seq 是指通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DN**段,并对其进行纯化和文库构建;然后对富集得到的DN**段进行高通量测序,通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的 DNA 区段信息,是目前在全基因组水平研究蛋白结合靶DNA序列的重要手段,为转录因子、组蛋白修饰、核小体定位等表观遗传学的研究提供有效方法。

应用领域

1、确定组蛋白修饰的位置及其与基因表达的关系。

2、完成对转录因子及其它蛋白在基因组上结合位点的精细定位。

3、研究特定的核小体或组蛋白的分布。 在哺乳动物中CpG以两种形式存在。Chip-seq技术服务活动

提供样本DNA完整性质检结果。北京6mA技术服务经验丰富

联合亚硫酸氢钠的限制性内切酶分析法(COBRA)


这种方法是将亚硫酸氢盐处理与酶切相结合来进行甲基化检测。DNA样本经亚硫酸氢盐处理后,利用PCR扩增。扩增产物纯化后用限制性内切酶(BstUI)消化。若其识别序列中的C发生完全甲基化(5mCG5mCG),则 PCR扩增后保留为CGCG,BstU I能够识别并进行切割;若待测序列中,C未发生甲基化,则PCR后转变为TGTG,BstUI识别位点丢失,不能进行切割。这样酶切产物再经电泳分离、探针杂交、扫描定量后即可计算出原样本中甲基化的比例。


这种方法**的优点就是相对简单,可进行快速定量,且需要的样本量少。然而,它的局限性也十分明显,只能获得特殊酶切位点的甲基化情况,且阴性结果并不能排除样品DNA中存在甲基化的可能。 北京6mA技术服务经验丰富

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