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甲基化DNA免疫沉淀测序(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,MeDIP-Seq)是通过5mC特异性抗体富集甲基化的DN**段,然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量,快速、高效地寻找甲基化区域。可广泛应用于甲基化与疾病关系研究。技术优势全基因组范围鉴定甲基化修饰区域针对性检测基因组内具有甲基化修饰的区域与WGBS技术相比,成本更低科学方案设计从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计及时高效的沟通;以保障高质量研究成果样本要求:基因组DNA:>=3ug;样品浓度>50ng/ul;无RNA和蛋白污染建库测序:测序策略:IlluminaHiSeq,PE150。 细胞、全血、组织样本干冰运输。江苏WGBS技术服务
荧光定量法(Methylight)
这种技术是在MSP技术上发展起来的,在MSP扩增过程中利用荧光染料进行定量。TaqMan? 探针法的应用使得该技术具有更高的精确性。其原理与SNP检测类似,针对亚硫酸氢盐处理之后的DN**段,在甲基化位点上会存在单碱基的差异,根据这种差异进行探针设计,随后进行实时定量PCR,就能够检测甲基化的差异。这种方法**的优势在于其高敏感性和较高通量,且无需在PCR后电泳、杂交等操作,减少了污染和操作误差。但是TaqMan? 探针订购费用较高,适用于少数位点大量样本筛选。 上海850K芯片技术服务售后服务通过甲基化数据,筛选疾病耐药的差异甲基化。
2019国自然基金解析—甲基化研究专题。从生命科学部和医学科学部总体来看:2019年度,生命科学部获自然科学基金委批准资助6478项(不含杰出青年基金项目),批准资助金额共计,单项平均资助金额。2019年度,医学科学部共批资助10138项(不含杰出青年基金项目),批准资助金额共计,单项平均资助金额。从甲基化研究方向来看,与甲基化研究相关的项目总数达283项,项目总金额超过12669万元。其中生命科学部项目总数62项,项目金额3235万元,医学科学部项目总数221项,项目金额9434万元。从2011-2019年甲基化研究方向的项目金额和项目数目分析,整体呈上升趋势;从医学科学部来看,甲基化研究项目获批数量221项,项目金额达到9434万,较之2018年度项目获批金额(7166万元)上升趋势尤为明显,可以看出,甲基化研究日益成为国自然的研究热点。
全基因组甲基化测序(WholeGenomeBisulfiteSequencing,WGBS)是将重亚硫酸盐Bisulfite处理和高通量测序技术相结合,对有参考基因组进行全基因组范围的单碱基分辨率的甲基化测序,是DNA甲基化检测的“金标准”。WGBS满足全基因组DNA甲基化图谱及疾病关联分析、基因调控分析、疾病的甲基化标志物筛选等探索性课题的研究。技术优势DNA甲基化检测**有力的工具单碱基分辨率,检测每个C碱基的甲基化状态全基因组范围,**限度地获得甲基化信息适合所有有参考基因组的物种适合各种类型的样本样本要求:基因组DNA:>=3ug;样品浓度>30ng/ul;无RNA和蛋白污染建库测序:测序策略:IlluminaHiSeq,PE150;测序深度:>=30X信息分析基于全基因组范围的甲基化分析,数据质控,5mCCalling,5mC在基因组、染色体、功能元件上的分布,多样本甲基化差异聚类,差异甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析,结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。 全基因组甲基化分析及特异位点甲基化检测。
血清甲基化用于乳腺*转移早期筛查
Methylation patterns in serum
DNA for early identification of disseminated breast cancer. Genome
Med. 2017;22;9(1):115. (IF=
8.898)
本课题通过RRBS甲基化测序筛选组织(n=31)样本, 确定了18个乳腺*特异性甲基化位点,选择其中6个位点在大样本量血清样本(n=110)中得到进一步验证; 并通过更大量血清样本(n=1344), **终筛选出血清EFC#93甲基化位点为早期诊断和***转移性乳腺*Biomarker。 焦磷酸测序能提供基于序列测定的SNP检测、等位基因频率分析和甲基化检测。江苏技术服务活动
课题设计—RRBS及高通量BSP测序验证血浆EFC#93甲基化位点。焦磷酸测序技术是甲基化检测新的金标准。江苏WGBS技术服务
重亚硫酸盐处理结合测序是目前检测甲基化的金标准。除了全基因组甲基化测序技术等研究手段,对于大样本量甲基化研究来说,更需要灵活、有针对性的技术方案。NGS-BSP方法适合几个到几十个基因或者位点进行大样本甲基化测序或者验证项目,具有更快速的实验周期及低成本优势。技术优势高效灵活的目标区域甲基化检测的工具BSP和高通量测序完美结合,单碱基分辨率适合几个到几十个位点的大样本验证项目适合所有动物样本、周期快、检测位点灵活、性价比高科学方案设计从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计及时高效的沟通;以保障高质量研究成果样本要求:基因组DNA:>=1ug(20个区域/位点);样品浓度>30ng/ul;无RNA和蛋白污染建库测序:测序策略:IlluminaHiSeq,PE150;测序深度:>。 江苏WGBS技术服务
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