广东核酸拷贝数定量数字PCR经验丰富
数字PCR通过在一定体积内稀释DNA分子,实现DNA分子计数,从而提供了高精度拷贝数的估算。数字PCR技术在突破PCR扩增效率限制的同时,结果也有很高的重现性。和传统PCR相比,数字PCR技术检测遗传稀有突变时具有更高的灵敏度,在对于低水平痕量DNA分析也有更可靠的结果。数字PCR具有高敏感度、***定量、高特异性、使用标本用量少等特点,可以为临床提供更客观、自动化程度更高的定量检测结果,而且较好的克服了**组织包埋标本DNA质量差、标本量有限等问题,目前已经被应用于多个研究领域,有望成为恶性**的诊断和监测的可靠工具。外泌体里面的micRNA含量是非常低的。广东核酸拷贝数定量数字PCR经验丰富
液滴数字PCR源于乳液PCR( emulsion PCR) 技术,即将DNA模板与连接引物的磁性微球以极低的浓度(比如单拷贝) 包裹于油水两相形成的纳升至皮升级液滴中进行 PCR 扩增,扩增后的产物富集在磁性微球上,收集破乳后进行测序。通过油水两相间隔得到的以液滴为单位的 PCR 反应体系,比微孔板和 IFC 系统更容易实现小体积和高通量,而且系统简单,成本低,因此成为理想的数字PCR技术平台。Vogelstein 及其同事提出的 BEAMing 技术就是一种基于乳液PCR的数字PCR系统。Lu 等也采用 BEAMing 和连接酶反应实现对 mRNA 的定量分析。Zhou 等在 BEAMing PCR 扩增后破乳,将连接不同产物的磁珠包被在聚丙烯酰胺凝胶中制成磁珠阵列进行荧光检测。Digital PCR数字PCR低丰度DNA模板分子的精确定量。
使用不合适的引物可能会引入引物二聚体、非特异性扩增等,进而影响实验结果的准确性。在此,小Q建议您在设计引物时需做以下几个方面的检查,***需对设计好的引物进行BLAST比对分析,以确保引物的特异性!在数字PCR***定量实验中,对于基因突变检测、基因表达差异分析和拷贝数变异鉴定等对实验精细性要求较高的实验,需要特异性更高的Assay。QIAGEN基于QIAcuity数字PCR平台开发并验证了针对上述常见应用的700多组dPCR LNA Assay,所有Assay均经过锁核酸修饰来增强其对互补序列的亲和力和特异性,进而提高实验结果的准确性。
数字PCR(Digital PCR-dPCR)技术是一种新的核酸检测和定量方法,与传统定量PCR(qPCR)技术不同,数字PCR采用***定量的方式,不依赖于标准曲线和参照样本,直接检测目标序列的拷贝数。由于这种检测方式具有比传统qPCR更加出色的灵敏度和特异性、精确性,dPCR迅速得到***的应用,这项技术在极微量核酸样本检测、复杂背景下稀有突变检测和表达量微小差异鉴定方面变现出的优势已被普遍认可,而其在基因表达研究、microRNA研究、基因组拷贝数鉴定、**标志物稀有突变检测、致病微生物鉴定、转基因成分鉴定、NGS测序文库精确定量和结果验证等诸多方面具有的广阔应用前景已经受到越来越多的关注。提高检测通量,可对多个靶标多个标本并行检测。
(5)在SARS-CoV-2核酸参考品制备中,数字PCR能够对核酸进行精确的定量,能够提高世界各国SARS-CoV-2核酸测量结果的一致性和准确性。(6)数字PCR能够灵敏检测与定量环境中的病毒RNA浓度,包括从不同环境中取样的样本(如公共区域、病房、医院卫生间、实验室操作员手套、废水等等)。(7)在实验室样品与临床样品病毒突变检测中,数字PCR适合用于已知的SARS-CoV-2遗传变异检测,特别是对于一些低频突变。(8)在抗病毒药物的研发过程中,病毒载量的变化是评估药物有效性的重要指标,借由数字PCR提供的***定量结果,能够给出更具说服力和准确的评价结果。增加引物或探针的Tm值,从而实现更短的引物和探针设计。北京Digital PCR数字PCR欢迎咨询
目前有超过130万条经锁核酸修饰的引物,提供至少3种设计方案以满足不同跨外显子区域的检测需求。广东核酸拷贝数定量数字PCR经验丰富
单细胞的基因表达分析:基因表达分析有助于了解细胞和组织的特征及其如何应对发育和环境信号的改变。检测已知和未知基因转录水平的方法在过去的四十多年来发生了翻天覆地的变化,变得更加有效,更加敏感,定量更加精细,能够一次性对大量的基因转录本进行分析。但是,在组成复杂的细胞混合物中,尽管***表达的基因可以被识别出来,但来自于少数细胞群体(例如干细胞)的转录本却很可能会被掩盖掉,尤其是在每个细胞中以低丰度形式出现的转录本。为了解决这个问题,单细胞检测技术应用而生,而且逐渐受到了越来越多的重视。ddPCR在单细胞分析中的优势在于它不需要标准曲线就能进行***定量。而且,由于能够以非常高的敏感性区分至少五种不同的基因转录本,因此无需进行其他方法所要求的单细胞cDNA预扩增,这可以消除预扩增和NGS文库准备中潜在的转录本定量失真,能够能加真实的反映单细胞群体中关键基因的特征。广东核酸拷贝数定量数字PCR经验丰富