北京TAB-SeqDNA甲基化共同合作

N6-甲基脱氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修饰类型之一，在细菌、藻类及植物基因组中***存在，在DNA错配修复、染色体分离和毒力调节中发挥作用。6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DN**段，然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量，快速、高效地寻找6mA甲基化区域。技术优势：全基因组范围鉴定6mA甲基化修饰区域技术方法适合所有物种(一般推荐藻类及植物)。科学方案：设计从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序，到数据分析每个项目有特定的科学问题；需要专业、有价值的建议；科学、缜密的设计及时高效的沟通；以保障高质量研究成果。TBS具有高深度、定量、高准确性 。北京TAB-SeqDNA甲基化共同合作

羟甲基化DNA免疫沉淀测序（HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，hMeDIP-Seq）是通过5hmC特异性抗体富集羟甲基化的DN**段，然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量，快速、高效地寻找羟甲基化区域。可广泛应用于羟甲基化与疾病关系研究以及羟甲基化在胚胎发育过程中的研究。技术优势：从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序，到数据分析每个项目有特定的科学问题；需要专业、有价值的建议；科学、缜密的设计及时高效的沟通；以保障高质量研究成果辽宁hMeDIP-SeqDNA甲基化活动WGBS技术及应用是有力方案。

DNA甲基化在**转移过程中发挥着重要作用，如有研究发现了数个可以诱导EMT的转录因子，在正常细胞中它们表现为高甲基化水平因而其表达受到抑制，但在**细胞中它们的甲基化水平偏低而出现高表达。利用DNA甲基转移酶（methyltransferase）抑制剂5-氮杂胞苷（5-aza-cytidine）处理MCF-7乳腺*细胞，使其维持低甲基化状态，结果显示与EMT过程相关的促细胞侵袭基因（pro-invasive EMT-associated gene）表达上调，细胞的侵袭能力和转移能力增强。此类研究结果值得我们深思，采用DNA甲基转移酶抑制剂来*****固然可能抑制原*基因的表达，但也可能造成**细胞转移播散增加的风险。

6mA免疫沉淀测序(6mA-IP Seq)通过特异性抗体富集6mA甲基化的DN**段，结合NGS测序技术在全基因组水平上分析6mA修饰信息。6mA样本要求：基因组DNA:>=5ug；样品浓度>50ng/ul；无RNA和蛋白污染建库测序：测序策略：IlluminaHiSeq,PE150；测序深度:20-30MReads。信息分析：基于全基因组范围的6mA分析，数据质控、Peak锋Calling,Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布,多样本甲基化差异聚类、DMR鉴定及相关基因的功能分析，结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。WGBS和RRBS都是金标准技术, CNS发表文章都很多，广发被接受。

焦磷酸测序样品要求：·样品类型细胞、新鲜组织或DNA样品·样品量细胞样品请提供至少1×106个细胞，组织样品请提供至少100mg的组织块或切片，DNA样品请提供1μg以上的DNA·样品质量基因组DNA无明显降解，主带清晰，大于23Kb，无明显弥散。OD260/280值在1.8～2.0之间，浓度≥50ng/μl·样品保存细胞样品或新鲜组织块（切成～50mg的小块）可液氮冻存后，-80℃保存。DNA样品可溶于乙醇或超纯水中，-80℃保存。样品保存期间避免反复冻融·样品运输样品置于1.5ml冻存管中，封口膜封好，干冰运输。全基因组甲基化测序是将重亚硫酸盐Bisulfite处理和高通量测序技术相结合。上海焦磷酸测序DNA甲基化售后服务

焦磷酸测序技术服务基于QIAGEN公司的PyroMark Q96 ID平台。北京TAB-SeqDNA甲基化共同合作

焦磷酸测序（Pyrosequencing）技术服务基于QIAGEN公司的PyroMarkQ96ID平台，能提供基于序列测定的SNP检测、等位基因频率分析和甲基化检测，杂合子缺失及细菌和病毒分型等技术服务。优势：得到定量序列结果的技术，极高的准确性，重现性**，实验设计灵活。应用：可以用于任何遗传多态性的分析甲基化研究的平台通量、低成本的快速临床微生物诊断。报告模板：1材料1.1试剂与试剂盒1.2仪器2方法2.1DNA抽提2.1甲基化修饰2.2纯化亚硫酸盐修饰的DNA2.3甲基化PCR2.4Pyrosequencing检测。北京TAB-SeqDNA甲基化共同合作