上海hMeDIP-SeqDNA甲基化售后分析

甲基化DNA免疫沉淀测序（MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，MeDIP-Seq）是通过5mC特异性抗体富集甲基化的DN**段，然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量，快速、高效地寻找甲基化区域。可广泛应用于甲基化与疾病关系研究。样本要求：基因组DNA:>=3ug；样品浓度>50ng/ul；无RNA和蛋白污染，建库测序：测序策略：IlluminaHiSeq,PE150;测序深度：20-30Mreads。信息分析：基于全基因组范围的羟甲基化分析，数据质控，Peak锋Calling，Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布，多样本羟甲基化差异聚类，差异羟甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析，结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。ATAC-seq实验过程短，从实验到分析可达2周。上海hMeDIP-SeqDNA甲基化售后分析

甲基化研究项目各学科细分分析：从各学科细类中标金额和中标数量分析，**学依然是甲基化研究的热点方向，该方向总计中标金额2217万元，中标数量57项。其它细分学科包括预防医学、遗传学与生物信息学、检验医学也占有不少份额。甲基化研究项目各单位中标情况分析：经过整理，甲基化项目类中标单位共105家单位，按中标项目金额排列如下（截取部分超过百万的项目）。甲基化研究方向细分热点分析："游离DNA甲基化"、"m6A-RNA甲基化"，“羟甲基化”等均是甲基化研究方向的重点关注内容。尤其值得关注的是m6A相关研究近年来呈直线上升态势，成为国自然的热点。天津焦磷酸测序DNA甲基化活动RRBS用于人、哺乳动物及鱼类方向的高水平甲基化研究。

低甲基化，原*基因***正常细胞中，由于甲基化作用原*基因多处于沉默状态，但在多种**细胞中，均发现原*基因处于低甲基化状态，并且低甲基化状态与其蛋白表达升高密切相关，表明低甲基化状态可使原*基因***。转座子活化转座子是可移动的基因序列，包括LINE-1、HERV-K等，在人类基因组中含量丰富，正常情况下处于被甲基化状态而转录沉默。而在**细胞中，由于基因组总体甲基化水平的降低，这些序列也因去甲基化而活化，转移位置导致基因片段的插入和缺失。

DNA甲基化作为表观遗传学研究的重要范畴，已经越来越受到研究者的关注。近些年来，随着DNA甲基化与组蛋白甲基化的联合作用机制、RNA干扰机制及去甲基化机制的发现，使得DNA甲基化研究受到***关注，从医学领域扩展到动植物研究当中，同时在研究方法上也取得了很大的突破。现在用于DNA甲基化检测的方法大概有十多种，从应用上来分，大致可以分成两类：全基因组甲基化分析及特异位点甲基化检测。下面，我们就这两大类检测技术进行分析比较，以便于在实际的科研工作中进行选择。提供样本DNA完整性质检结果。

2019年国自然情况：从生命科学部和医学科学部总体来看：2019年度，生命科学部获自然科学基金委批准资助6478项（不含杰出青年基金项目），批准资助金额共计32.71亿元，单项平均资助金额50.49万元。2019年度，医学科学部共批资助10138项（不含杰出青年基金项目），批准资助金额共计44.13亿元，单项平均资助金额43.53万元。甲基化研究整体项目情况分析：从甲基化研究方向来看，与甲基化研究相关的项目总数达283项，项目总金额超过12669万元。其中生命科学部项目总数62项，项目金额3235万元，医学科学部项目总数221项，项目金额9434万元。从2011-2019年甲基化研究方向的项目金额和项目数目分析，整体呈上升趋势；从医学科学部来看，甲基化研究项目获批数量221项，项目金额达到9434万，较之2018年度项目获批金额（7166万元）上升趋势尤为明显，可以看出，甲基化研究日益成为国自然的研究热点。全基因组甲基化分析及特异位点甲基化检测。天津RRBSDNA甲基化共同合作

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