北京RRBSDNA甲基化专业服务

WGBS：科学方案设计：从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序，到数据分析每个项目有特定的科学问题；需要专业、有价值的建议；科学、缜密的设计及时高效的沟通；以保障高质量研究成果。样本要求：基因组DNA:>=3ug；样品浓度>30ng/ul；无RNA和蛋白污染建库测序：测序策略：IlluminaHiSeq,PE150；测序深度：>=30X。信息分析：基于全基因组范围的甲基化分析，数据质控，5mCCalling，5mC在基因组、染色体、功能元件上的分布，多样本甲基化差异聚类，差异甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析，结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。850K芯片为半金标准，价格低，分析简单，较为适合EWAS类型的课题。北京RRBSDNA甲基化专业服务

羟甲基化DNA免疫沉淀测序（HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing，hMeDIP-Seq）是通过5hmC特异性抗体富集羟甲基化的DN**段，然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量，快速、高效地寻找羟甲基化区域。可广泛应用于羟甲基化与疾病关系研究以及羟甲基化在胚胎发育过程中的研究。样本要求：基因组DNA:>=3ug；样品浓度>50ng/ul；无RNA和蛋白污染建库测序：测序策略：IlluminaHiSeq,PE150;测序深度：20-30Mreads。信息分析：基于全基因组范围的羟甲基化分析，数据质控，Peak锋Calling，Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布，多样本羟甲基化差异聚类，差异羟甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析，结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。辽宁oxBSDNA甲基化口碑推荐全基因组甲基化分析及特异位点甲基化检测。

全基因组甲基化测序（Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS）是将重亚硫酸盐Bisulfite处理和高通量测序技术相结合，对有参考基因组进行全基因组范围的单碱基分辨率的甲基化测序，是DNA甲基化检测的“金标准”。WGBS满足全基因组DNA甲基化图谱及疾病关联分析、基因调控分析、疾病的甲基化标志物筛选等探索性课题的研究。技术优势：DNA甲基化检测**有力的工具，单碱基分辨率，检测每个C碱基的甲基化状态，全基因组范围，**限度地获得甲基化信息，适合所有有参考基因组的物种适合各种类型的样本。

甲基化研究项目各学科细分分析：从各学科细类中标金额和中标数量分析，**学依然是甲基化研究的热点方向，该方向总计中标金额2217万元，中标数量57项。其它细分学科包括预防医学、遗传学与生物信息学、检验医学也占有不少份额。甲基化研究项目各单位中标情况分析：经过整理，甲基化项目类中标单位共105家单位，按中标项目金额排列如下（截取部分超过百万的项目）。甲基化研究方向细分热点分析："游离DNA甲基化"、"m6A-RNA甲基化"，“羟甲基化”等均是甲基化研究方向的重点关注内容。尤其值得关注的是m6A相关研究近年来呈直线上升态势，成为国自然的热点。不同的芯片平台，各自的实验过程也是不一样的。

恶性**细胞从**原发部位，经过淋巴道、血管或体腔等途径，到达身体其他部位继续生长，称为**转移。**转移是*****中的**障碍，也是目前**患者死亡的主要原因。近年来，临床上为了成功进行*****，对**的侵袭和转移进行了大量的研究，发现其中有很多方面和DNA甲基化相关。上皮-间质转化（epithelial mesenchymal transition, EMT）指上皮细胞向间质细胞转化的现象，研究表明EMT在**形成和转移过程中也发挥了非常重要的作用。EMT时上皮组织基本结构消失，如失去细胞间粘附和细胞极性、细胞内骨架重排等，获得间质细胞特性（如细胞迁移能力、侵袭能力、抗凋亡能力等）。EMT**初是在细胞体外培养过程中发现的，随着人们对人体**和实验动物模型的观察越来越深入，发现EMT过程与**发生过程密切相关。尤其是EMT过程对于**浸润（invasion）、转移（metastatic dissemination）以及药物耐受等都有关系，而与EMT过程相对的间质-上皮转化（mesenchymal epithelial transition, MET）过程则似乎是在**细胞播散之后形成转移灶过程中起到重要作用。云生物提供甲基化服务。北京RRBSDNA甲基化专业服务

RRBS开发的初衷就是为人和哺乳动物，提供全基因组范围的、高性价比的甲基化检测金标准方案。北京RRBSDNA甲基化专业服务

第三代测序技术的出现，更是让甲基化的直接测定成为可能。一年前，美国PacificBiosciences公司利用独有的单分子实时(SMRT)测序技术，直接测定了DNA的甲基化。这项成果发表在《NatureMethods》杂志上。甲基化特异性PCR（MS-PCR）：DNA在亚硫酸氢盐作用后，DNACpG若无甲基化，则序列中的C改变为U，若有甲基化则保持不变，因此从理论上讲，用不同的引物做PCR，即可检测出这种差异，从而确定基因有无CpG岛甲基化。因此根据目的基因修饰前后的改变，就可以相应设计M和U引物，有时我们需要设计两轮引物。这种方法灵敏度高，无需特殊仪器，因此经济实用，是目前应用**为***的检测方法。不过也存在一定的局限性，预先需要知道待测片段的DNA序列，引物的设计非常重要。另外，亚硫酸氢盐处理也十分关键，若处理不完全则可能导致假阳性的出现。北京RRBSDNA甲基化专业服务