TraPR功能性小RNA提取试剂盒Lexogen试剂盒代理
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:良好的重现性和无脱靶效应:RiboCop表现出极好的稳定性的和重复性。相关图显示了不同重复之间极好的重现性。额外显示未经处理的与ribo-depleted样本转录本丰度之间有高度的相关性:不同的input范围,以及跨越不同物种。表明RiboCop去除细菌rRNA不会产生脱靶效应。RiboCop表现出极好的重现性。以10ng总RNA为input量的两个**实验结果表现出很好的一致性。总RNA分别用RiboCop革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌rRNA去除试剂盒处理。云生物专业致力于Lexogen试剂盒批发。TraPR功能性小RNA提取试剂盒Lexogen试剂盒代理
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 广东QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒Lexogen试剂盒云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:RNA input范围宽、性能表现优异、转录组丰度无偏差:核糖体RNA占到细菌转录本的98%。有效去除rRNA可以大幅降低测序成本,并实现对细菌转录组的***分析。为展示RiboCop 细菌核糖体RNA 去除试剂盒的性能,用RiboCop 革兰氏阴性rRNA去除试剂盒对E. coli 的总RNA进行rRNA去除处理(input:1 ng - 1 μg)。对于所有测试input量,RiboCop有效地将rRNA reads数从98%降低到1- 3%,同时维持转录组丰度的无偏差,无脱靶效应。
Globin mRNA Block模块:
使用Globin Block在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物学及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。Globin mRNAs(HBA1, HBA2, HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因的检测和定量的灵敏度。其他Globin RNA的去除方法需要对RNA进行前处理,需要高起始量的RNA,额外增加成本。
Globin Block可降低Globin RNA Mapped Reads至0.7%:使用Globin Block模块的文库比标准Quantseq文库***降低了总Globin RNA mapped read百分比。在白膜层样品和全血中,使用Globin Block模块可使总Globin RNA mapped read百分比分别低至0.7%和9.7%。
QuantSeq 自动化:Lexogen可提供QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建流程的自动化版本。在自动化平台上构建Illumina兼容的 3’mRNA-Seq文库,能够提供9,216个i5 / i7 index组合,能实现高通量、大规模基因表达检测。自动化减少了手动操作的时间,提高通量,避免手动操作误差和样本错乱。
自动化 QuantSeq 数据分析:Bluebee Genomics Platform**为QuantSeq 3’ mRNASeq文库构建试剂盒(FWD和REV)的数据提供分析。Lexogen为每个试剂盒提供一个密码,使用者可以登录该平台分析数据。也可用Partek Flow (license required)平台进行数据分析。
Lexogen试剂盒的优缺点您知道吗?
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:Lexogen的RiboCop细菌核糖体RNA去除试剂盒基于磁珠捕获(无酶促反应),自动化友好的工作流程去除细菌总RNA中的rRNA。RiboCopinput范围宽泛(1ng-1μg),适用于完整的及降解的RNA。针对革兰氏阴性、革兰氏阳性和混合细菌种类进行优化的探针设计以确保转录组结果的无偏差(无脱靶效应),同时有效地去除23S、16S和5SrRNA。细菌中rRNA的含量可高达98%,对于细菌转录组分析来说具有一定的挑战性,特别是在分析复杂细菌群落的转录组时,难度更大。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒可有效地从混合细菌样品或单一菌株中去除23S、16S和5SrRNA。兼容完整的以及降解的RNA样本,工作流程简单、高效。rRNA去除后的RNA样品适用于NGS文库的制备及类似的应用,为细菌转录组组成提供一个***的分析方案。RiboCop通过杂交捕获去除不需要的rRNA:RiboCop采用一套亲和探针,可从完整的及降解的RNA中特异和高效地去除rRNA序列。Lexogen精密的探针设计**限度地减少了可能导致NGS数据发生偏差的脱靶效应。Input量可低至1ng,高至1μg的总RNA,取决于样品组成和使用的产品类型。rRNA去除试剂盒中**的探针池可用于革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌。 Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?浙江QuantSeq Data AnalysisLexogen试剂盒哪家好
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SLAMseq代谢标记试剂盒:标准的RNA-seq方法可以评估总RNA丰度,但不能解决RNA转录和降解整体动态水平的动力学问题。SLAMseq系列产品以时间作为RNA-Seq的一个新维度,能同时对新合成的和已有的RNA进行定量分析。产品优势:可进行转录组--RNA合成及降解的动力学分析;获取控制基因表达的新见解;建立刺激诱导的RNA转录和降解之间序列改变的模型;通过比较新生转录水平,***提高差异表达的分辨率;只需向RNA-Seq工作流添加两个步骤,无需pull-down实验或生化隔离;对于时间分辨的RNA-seq,整合了Lexogen’sSLAMseq标记试剂盒,QuantSeq3’mRNA-Seq文库构建试剂盒,以及SLAMdunk分析软件。工作流程:SLAMseq系列产品是基于一种新的全转录组定量、快速和可靠的标记方法:通过硫醇(SH)烷基化标记用于RNA的代谢测序1。用核苷酸类似物4-硫代嘌呤(4-Thiouridine,S4U)与细胞孵育,S4U被细胞摄入,并整合到新转录的,新生的RNA中。该工作流程的关键特点是烷基化步骤,使用碘乙酰胺(iodoacetamide,IAA)修饰S4U核苷酸,导致核苷酸在逆转录过程中发生转化。因此,S4U标记的转录本,在测序读取过程中,会导致胸腺嘧啶变成胞嘧啶(T>C)。 TraPR功能性小RNA提取试剂盒Lexogen试剂盒代理