青海线粒体小基因组测序服务

在高等生物细胞内除了细胞核遗传外，细胞质遗传也是重要的研究方向。细胞质中主要的遗传物质的载体是线粒体和叶绿体。利用高通量测序技术对动植物线粒体基因组及植物叶绿体基因组进行测序组装，突破传统mt/cpDNA分离提纯的实验壁垒，可直接利用组织总DNA获得线粒体/叶绿体基因组，对序列信息进行深入解析，通过比较基因组分析获得物种分类、系统进化、地理谱系遗传等信息。云生物自主研发的Enrichment富集技术，可降低核DNA污染，将总DNA中靶细胞器基因组比例提升。专业生物信息团队，提供人工基因注释矫正，满足NCBI数据库上传要求，高质量结果交付，助力高水平研究。云生物自主研发的Enrichment富集技术，可降低核DNA污染，将总DNA中靶细胞器基因组比例提升。青海线粒体小基因组测序服务

    叶绿体多态基因组SSR的开发和验证：叶绿体基因组具有古老的遗传模式，对进化过程具有独特见解，cpSSR基因座通常分布在整个非编码区域，其序列变异高于编码区，cpSSR标记可用于揭示群体遗传变异和系统地理学模式。在Oresitrophe和Mukdenia***鉴定出242个候选多态性gSSR。筛选后获得126个多态性gSSR，两个属之间的标准偏差范围为。为了研究SSR的可转移性，研究人员选择了12对候选polySSRs引物和6个群体，用于。计算两个物种的遗传多样性参数。结果显示，多态性信息含量范围为，等位基因数量范围为2-11，观察到的杂合性和预期杂合度分别为。在K=2时，根据不同的物种将所有六个群体分成两个群集。此外，对于K=3，4个，其中HBQL，TJLX和BJCP分配到一个群集中，HNYD分成第二群集。通过结构分析检测到的Mukdeniarossii和Oresitropherupifraga中基因库的成员概率和地理分布：K=2（a）和K=3（b）。每个垂直条**一个个体（N=47），种群由东北到中国的收集地点排列。 天津植物叶绿体基因组小基因组测序服务云生物主营业务包括小基因组测序测序和分析。

    线粒体和叶绿体的基因组与细菌基因组具有明显的相似性，线粒体和叶绿体具有细菌基因组的典型特征。它们均为单条环状双链DNA分子，不含5-甲基胞嗨睫，无组蛋白结合并能进行**的复制和转录。此外，在碱基比例、核背酸序列和基因结构特征等方面，线粒体和叶绿体基因组也与细胞核基因组表现出***差异，而与原核生物极为相似。同时，线粒体和叶绿体具有自身的DNA聚合酶及RNA聚合酶，能**复制和转录。线粒体和叶绿体具备**、完整的蛋白质合成系统。线粒体和叶绿体的蛋白质合成机制类似于细菌，而有别于真核生物。例如，与细菌一样，线粒体和叶绿体中蛋白质的合成从N-甲酰甲硫氨酸开始，而真核细胞中蛋白质的合成从甲硫氨酸开始；线粒体和叶绿体的核糖体较小于真核生物80S核糖体；线粒体、叶绿体和原核生物的核糖体中只有5SrRNA,而不少真核细胞的核糖体中存在SrRNA；线粒体RNA聚合酶可被原核细胞RNA聚合酶的***剂（如利福霉素）所***，但不被真核细胞RNA聚合酶的***剂（如放线菌素D）所***等。

    叶绿体和线粒体有自己的基因组、蛋白质合成系统和膜系统，说明这两种细胞器具有自我繁殖所必须的基本物质，能够进行转录和翻译，这就保证了它们在真核细胞中仍然有一定程度的自主性。有关线粒体遗传的研究，已经清楚地显示出了线粒体的自主性。通过细胞的结合，一种细胞的线粒体可以在杂种细胞及其后代的体内生活和增殖。不仅一种动物的线粒体可以生活在另一种动物的细胞中，而且连叶绿体都可以人工地使它们生活在动物细胞中。例如，在离体的小鼠成纤维细胞的培养基中加入菠菜叶绿体，半小时就可以看到有些叶绿体已经在小鼠的细胞中生存。事实上，叶绿体在***外也能独自生存相当长的时间。例如，把刺海松(一种管藻)的叶绿体培养在简单的无机培养基中，5d后它们仍然能够进行光合作用。 云生物提供叶绿体与线粒体片段交流分析。

线粒体基因组与疾病研究：线粒体是生物细胞内的能量工厂，具有单独的基因组。线粒体是核外**含有遗传效应物质的细胞器,能够**进行基因的转录、翻译和蛋白质的表达，起基因组约占人类基因组的1%，比核DNA突变率高约10倍,损伤修复能力比核DNA低。研究线粒体基因组序列，有助于研究细胞代谢，线粒体遗传病及法医研究等。云生物拥有多种物种线粒体基因组检测专利，可以快速准确的测序线粒体基因组。同时利用数字PCR仪，还可对线粒体数目进行精确的拷贝数定量，还可以用焦磷酸测序仪对线粒体多态性和异质性进行检测。通过比较基因组分析获得物种分类、系统进化、地理谱系遗传等信息。四川细胞质遗传小基因组测序要多少钱

小基因组泛指基因组在1M以内的基因组。青海线粒体小基因组测序服务

1.测序数据概况

(1) 原始测序数据说明

(2) 测序数据质控及统计

(3) 三代测序数据统计

2.基因组组装

3. 基因组组分分析

(1) 编码基因分析

(2) ORFs扫描及跨膜结构预测

(3) 非编码RNA分析

4. 基因功能注释

 基因组圈图

高级分析：

比较基因组分析

1.SNP检测与注释

2.Indel检测与注释

3.SV检测

4.基因组共线性分析

5.线粒体与叶绿体基因组片段交流分析

6.共有和特有基因分析

7.系统进化分析、选择压力分析

定制化生信分析

1.密码子偏好性分析

2.长重复序列Long repeat分析

3.简单重复序列SSR分析

4.基因表达量及表达差异分析（可由客户提供RNAseq） 青海线粒体小基因组测序服务