山东RNA质控标准品Lexogen试剂盒销售
Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒:QuantSeq-Pool加快基因表达项目研究。LexogenQuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3'mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。通量灵活,适用于大规模的通量项目。在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDIindex,以获得更高的通量。稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度。高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100K至1M。这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。 买Lexogen试剂盒找云生物。山东RNA质控标准品Lexogen试剂盒销售
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒代理Lexogen试剂盒报价多少呢?SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。
SLAMseq代谢标记试剂盒:产品应用:测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。 Lexogen试剂盒的不同系列会有不同的优势。
QuantSeq Data Analysis:
63.02 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-2 GB2 GB
63.06SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-6 GB6 GB
63.12SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-12 GB12 GB
63.25SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-25 GB25 GB
090.24QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24 runs24
091.24QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24
093.03QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
093.06QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB
094.03QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
094.06QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB 云生物就带您了解一下Lexogen试剂盒的特点。天津CORALL Total RNA-seq文库构建试剂盒Lexogen试剂盒销售
上海Lexogen试剂盒代理哪家好?山东RNA质控标准品Lexogen试剂盒销售
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:Lexogen的RiboCop细菌核糖体RNA去除试剂盒基于磁珠捕获(无酶促反应),自动化友好的工作流程去除细菌总RNA中的rRNA。RiboCopinput范围宽泛(1ng-1μg),适用于完整的及降解的RNA。针对革兰氏阴性、革兰氏阳性和混合细菌种类进行优化的探针设计以确保转录组结果的无偏差(无脱靶效应),同时有效地去除23S、16S和5SrRNA。细菌中rRNA的含量可高达98%,对于细菌转录组分析来说具有一定的挑战性,特别是在分析复杂细菌群落的转录组时,难度更大。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒可有效地从混合细菌样品或单一菌株中去除23S、16S和5SrRNA。兼容完整的以及降解的RNA样本,工作流程简单、高效。rRNA去除后的RNA样品适用于NGS文库的制备及类似的应用,为细菌转录组组成提供一个***的分析方案。RiboCop通过杂交捕获去除不需要的rRNA:RiboCop采用一套亲和探针,可从完整的及降解的RNA中特异和高效地去除rRNA序列。Lexogen精密的探针设计**限度地减少了可能导致NGS数据发生偏差的脱靶效应。Input量可低至1ng,高至1μg的总RNA,取决于样品组成和使用的产品类型。rRNA去除试剂盒中**的探针池可用于革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌。 山东RNA质控标准品Lexogen试剂盒销售