江苏QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒多少钱
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与***领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精细信息。Makers和质控品是**可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量和数据可比性。产品优势:通用的标准品,用于比较分析和监控整个RNA测序实验;验证RNA测序流程,发现测序错误的来源和偏差,改善RNA测序从建库到数据分析的整个流程;兼容所有的测序平台,各种生物来源的RNA,甚至单细胞水平的RNA;通过综合设计,*****isoform和转录组丰度的复杂性;提供三套不同的标准品(SIRV1,2,3),适用于复杂的isoform表达分析以及简单的样品之间的比较。工作流程:Spike-InRNAVariant(SIRV)对照质控品是人工转录本,*****了转录组的复杂性,实验过程中将其掺入样品(匀浆组织/细胞或纯化的RNA)中,标准品的数据量占总reads数的1-2%。通过SIRV的数据分析,可以评估RNA测序过程的精度和准确性,以确定每个处理样本的技术噪音。然后根据质量评测和偏差系数来计算实验之间的一致性。 那么Lexogen试剂盒的优势都有哪些呢?江苏QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒多少钱
Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒:QuantSeq-Pool加快基因表达项目研究。LexogenQuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3'mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。通量灵活,适用于大规模的通量项目。在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDIindex,以获得更高的通量。稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度。高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100K至1M。这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。 北京胶提取Lexogen试剂盒报价Lexogen试剂盒的好处有很多。
SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAM-ITseq: 确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达。对于该应用,将4-硫尿嘧啶(4-Thiouracil,不是LAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNA -seq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushima et al.,2018)。 SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM -ITseq数据兼容,可对其进行分析。
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 Lexogen试剂盒报价多少呢?TraPR功能性小RNA提取试剂盒:小RNA是基因表达的重要调控因子,并参与各种调控通路,如**、炎症和发育。此外,sRNAs可以作为疾病检测或监测的生物标记物,也可以作为药物靶点。这些sRNAs与Argonaute家族(AGOs)的特定蛋白结合,形成RNA诱导的沉默复合体(RISCs),并引导AGO蛋白到达各自的靶点。目前特异性分离功能性sRNAs主要是通过免疫共沉淀(Co-IP)的方式。Co-IP是一种非常特异且灵敏的方法用于分离功能性sRNAs,但它有很大的局限性,**于一种感兴趣的生物体,需要昂贵且可用的抗体。另外,用商业化的sRNA提取试剂盒(膜柱法)对sRNA进行分离是一种比较快速、简单和廉价的方式,但特异性差,因为所有小于200nt的RNA都会被纯化。因此,RNAseq的大部分reads将被浪费在RNA降解产生的非功能性RN**段上。后者可通过繁琐的切胶回收等步骤来提高特异性,但是切胶回收仍然纯粹是基于片段的大小选择,因此不能区分功能性sRNAs和降解RN**段。迄今为止,还没有将AGOCo-IP的特异性与简单的商业化sRNA提取试剂盒相结合的方法。 Lexogen试剂盒批发就找云生物。江苏QuantSeq-Flex链合成模块Lexogen试剂盒代理
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