山东QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒哪家好

时间:2021年06月19日 来源:

QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2:QuantSeq-FlexRNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行**链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。产品优势:试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;>100多重引物的靶向文库构建;每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;识别已知和未知融合转录本;只需;节省测序成本,Dualindex兼容多达9,216种组合(i5/i7组合)。工作流程:使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:1)Oligo(dT)用于**链合成,随机引物用于第二链合成(QuantseqFWD);2)Oligo(dT)用**链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’mRNA-Seq);3)特异性靶向引物用于**链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);4)特异性靶向引物用于**链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。 Lexogen试剂盒的不同系列会有不同的优势。山东QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒哪家好

    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Quantseq在低质量RNA中的表现Quantseq在高质量和低质量(FFPE)样本中有很好的相关性:用同一来源的不同质量RNA样本进行比较,评估Quantseq适用于高度降解的样本(如FFPE样本)的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份,一份进行新鲜冷冻,一份处理成FFPE样本,从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值(RNA完整度)来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本,RIN值不适用于质量的评估,因此使用DV200值(大于200nt的RN**段的分布值)来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后,FFPE样本的DV200值为87%(RIN值),冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA,用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA,即使DV200值低至23%(数据未显示)仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程,对应冷冻样本,应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高(R²=),表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。 上海QuantSeq-Flex链合成模块Lexogen试剂盒销售厂家云生物销售的Lexogen试剂盒拥有完善的售后服务。

    SLAMseq代谢标记试剂盒产品应用测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。

    TraPR功能性小RNA提取试剂盒:小RNA是基因表达的重要调控因子,并参与各种调控通路,如**、炎症和发育。此外,sRNAs可以作为疾病检测或监测的生物标记物,也可以作为药物靶点。这些sRNAs与Argonaute家族(AGOs)的特定蛋白结合,形成RNA诱导的沉默复合体(RISCs),并引导AGO蛋白到达各自的靶点。目前特异性分离功能性sRNAs主要是通过免疫共沉淀(Co-IP)的方式。Co-IP是一种非常特异且灵敏的方法用于分离功能性sRNAs,但它有很大的局限性,**于一种感兴趣的生物体,需要昂贵且可用的抗体。另外,用商业化的sRNA提取试剂盒(膜柱法)对sRNA进行分离是一种比较快速、简单和廉价的方式,但特异性差,因为所有小于200nt的RNA都会被纯化。因此,RNAseq的大部分reads将被浪费在RNA降解产生的非功能性RN**段上。后者可通过繁琐的切胶回收等步骤来提高特异性,但是切胶回收仍然纯粹是基于片段的大小选择,因此不能区分功能性sRNAs和降解RN**段。迄今为止,还没有将AGOCo-IP的特异性与简单的商业化sRNA提取试剂盒相结合的方法。 Lexogen试剂盒的优缺点您知道吗?

    SLAMseq代谢标记试剂盒:标准的RNA-seq方法可以评估总RNA丰度,但不能解决RNA转录和降解整体动态水平的动力学问题。SLAMseq系列产品以时间作为RNA-Seq的一个新维度,能同时对新合成的和已有的RNA进行定量分析。产品优势:可进行转录组--RNA合成及降解的动力学分析;获取控制基因表达的新见解;建立刺激诱导的RNA转录和降解之间序列改变的模型;通过比较新生转录水平,***提高差异表达的分辨率;只需向RNA-Seq工作流添加两个步骤,无需pull-down实验或生化隔离;对于时间分辨的RNA-seq,整合了Lexogen’sSLAMseq标记试剂盒,QuantSeq3’mRNA-Seq文库构建试剂盒,以及SLAMdunk分析软件。工作流程:SLAMseq系列产品是基于一种新的全转录组定量、快速和可靠的标记方法:通过硫醇(SH)烷基化标记用于RNA的代谢测序1。用核苷酸类似物4-硫代嘌呤(4-Thiouridine,S4U)与细胞孵育,S4U被细胞摄入,并整合到新转录的,新生的RNA中。该工作流程的关键特点是烷基化步骤,使用碘乙酰胺(iodoacetamide,IAA)修饰S4U核苷酸,导致核苷酸在逆转录过程中发生转化。因此,S4U标记的转录本,在测序读取过程中,会导致胸腺嘧啶变成胞嘧啶(T>C)。 云生物就带您了解一下Lexogen试剂盒的特点。上海磁珠纯化Lexogen试剂盒销售

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    SmallRNA文库构建试剂盒:SmallRNA试剂盒建库流程简单,可在5个小时内完成smallRNA的建库(以totalRNA或富集好的smallRNA为模板)。可用于smallRNA的发现和分析,如microRNA或siRNA,这些smallRNA已被发现在基因表达调控中发挥关键作用。产品优势:5小时内即可完成测序文库的构建;input量范围宽:从50pg(富集好的smallRNA)或100ng(totalRNA)到1000ngRNA;适用于低RNA含量的样品,如血浆、血清和尿液;内含i7index,**多可同时对96个样品进行混样分析。工作流程:SmallRNA文库构建是通过将接头连接到TotalRNA或富集的smallRNA的3'和5'端。对于inputRNA,连接上5’端和3’端接头后,将反转录成cDNA,并通过PCR将i7端index引入到文库中,**多可以达96种index。通常情况下,特别是当inputRNA为富集好的microRNA时,构建好的文库可直接用于测序分析。对于totalRNA进行的smallRNA文库构建,可以用试剂盒中带的磁珠纯化模块除去接头自连片段,以及将smallRNA文库从totalRNA文库中分离出来。 山东QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒哪家好

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