QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒活动

时间:2021年06月18日 来源:

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品SIRV-Set2:SIRV-Set2:等摩尔isoformMixE0。它非常适合于成本敏感的应用和RNA-Seq实验,这些实验只需对复杂的isoform混合物进行检测,而不需要很深的测序深度来覆盖不同浓度转录本。SIRV-Set2非常适用于一致性的计算,因为实验的指纹图谱*依赖于SIRVisoform的复杂性而非浓度差异。SIRV-Set3:该组包含MixE0和ERCCMix,二者各占50%。69个SIRVisoform转录本和92个无重叠的ERCCRNA的混合物满足了参入(Spike-in)RNA质控品的复杂性需求,可兼顾isoform的高度复杂性和宽浓度范围的试验特性。可对整个RNA测序工作流程进行更***的质量评估和监测,并获得技术细节以及用于比较**样本和实验间的指纹图谱。单一的isoformERCC转录本覆盖6个数量级的浓度,辅以等摩尔浓度的SIRVisoform。 Lexogen试剂盒的主要特点都有哪些呢?QuantSeq FWD UMI第二连合成模块Lexogen试剂盒活动

Lexogen i5 6 nt UDI Add-on Kits (5001-5096):Lexogen 6碱基i5双Index Add-on试剂盒提供4个(5001-5004)或96个(5001-5096) Unique i5 index,与QuantSeq和CORALL Library Prep Kits兼容。96个 i5和96个i7 Indix结合使用,可实现多达9,216种不同的i5 / i7 index组合,从而 实现完全灵活的双端**的index。

货号产品描述规格047.4x24Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 24 rxn/Index4x24

047.4x96Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 96 rxn/Index4x96

047.96Lexogen i5 6 nt Unique Dual Indexing Add-on Kit (5001-5096), 1rx/Index96 上海RNA提取Lexogen试剂盒云生物Lexogen试剂盒拥有完善的售后。

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。

RiboCop细菌核糖体去除试剂盒良好的重现性和无脱靶效应:RiboCop表现出极好的稳定性的和重复性。相关图显示了不同重复之间极好的重现性。额外显示未经处理的与ribo-depleted样本转录本丰度之间有高度的相关性:不同的input范围,以及跨越不同物种。表明RiboCop去除细菌rRNA不会产生脱靶效应。RiboCop表现出极好的重现性。以10ng总RNA为input量的两个**实验结果表现出很好的一致性。总RNA分别用RiboCop革兰氏阴性菌和革兰氏阳性菌rRNA去除试剂盒处理。Lexogen试剂盒多种系列供您选择。

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