北京表达谱文库构建Lexogen试剂盒
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 Lexogen试剂盒的好处有很多。北京表达谱文库构建Lexogen试剂盒CORALLTotalRNA-seq文库构建试剂盒CORALL试剂盒:可以在(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。产品优势:完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析;整合UMIs,准确反映转录本信息;出色的链特异性(>99%)操作流程;低起始量(1ng-1μg),兼容mRNA捕获及核糖体去除建库;适用低起始量或低质量的FFPE样本;自动化友好。工作流程:CORALL文库构建基于特有的链置换终止和连接技术,首先置换终止引物(DSP,包含P7序列)3’端可随机结合到RNA模板上,然后进行反转录延伸,当延伸到下一个DSP时,延伸终止,因此文库构建过程不需要进行片段化。插入片段的大小取决于两个结合到模板RNA上DSP的距离。此外,这种终止可阻止伪第二链的合成,保持出色的链特异性。寡核苷酸连接序列可以与**链cDN**段的3’端进行高效的连接,同时引入P5序列和单分子标签(UMIs)。通过PCR进行第二链的合成和双链cDNA扩增,同时把i7和i5(可选)端index以及簇生成所需的完整接头序列引入到文库中。所有的核酸纯化都使用磁珠,操作流程高度匹配自动化。 山东rRNA去除Lexogen试剂盒多少钱云生物销售的Lexogen试剂盒拥有完善的售后服务。
QuantSeq Data Analysis:
63.02 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-2 GB2 GB
63.06 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-6 GB6 GB
63.12 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-12 GB12 GB
63.25 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-25 GB25 GB
090.24 QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24 runs24
091.24 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24
093.03 QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
093.06 QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB
094.03 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
094.06 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB
RiboCoprRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠):总RNA中包含大量核糖体RNA(rRNA),通常科研人员对这些rRNA不感兴趣。Lexogen公司的RiboCoprRNA去除试剂盒可以高效地从完整的或降解的大鼠、小鼠和人类总RNA样本中去除rRNA。去除rRNA后的RNA样本可以用于二代测序(NGS),或其它需求的RNA分析应用。产品优势:高度特异性去除(高达%)人类、小鼠、大鼠RNA样本中的细胞质rRNA(28S、18S、、5S、45S)和线粒体rRNA(mt16S、mt12S);适用于完整高质量的或降解的RNA(如FFPE样本);灵活的RNAinput量(1ng-1μg的总RNAinput量);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;简单稳定的工作流程—无酶促反应和机械剪切步骤;可以与任何RNA-seq文库构建试剂盒无缝对接(包括Lexogen公司的CORALLTotalRNA-Seq);NEW!流程更快:(包括20min的手动操作时间)。工作流程:亲和探针和总RNA(1ng–1μg)一起混合并变性,促进探针结合靶标序列。然后,在高温下进行RNA和探针的杂交,同时,rRNA去除磁珠可以从溶液中除去探针和杂交的核糖体RNA。***用磁珠纯化剩余的RNA完成整个过程。整个流程通过使用磁珠达到rRNA的***和纯化的目的,便于实现自动化操作,并可在2小时内快速、便捷的除去rRNA。 上海Lexogen试剂盒代理哪家好?
QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2:QuantSeq-FlexRNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行**链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。产品优势:试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;>100多重引物的靶向文库构建;每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;识别已知和未知融合转录本;只需;节省测序成本,Dualindex兼容多达9,216种组合(i5/i7组合)。工作流程:使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:1)Oligo(dT)用于**链合成,随机引物用于第二链合成(QuantseqFWD);2)Oligo(dT)用**链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’mRNA-Seq);3)特异性靶向引物用于**链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);4)特异性靶向引物用于**链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。 那么Lexogen试剂盒的优势都有哪些呢?浙江RNA提取Lexogen试剂盒多少钱
Lexogen试剂盒的各种系列应用领域还是不一样的。北京表达谱文库构建Lexogen试剂盒
GlobinBlock模块在血液RNA样本上的表现:使用GlobinBlock在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。GlobinmRNAs(HBA1,HBA2,HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因检测和定量的灵敏度。其他GlobinRNA的去除方法需要前处理RNA,需要高起始量的RNA,额外增加成本。LexogenQuantseq的GlobinBlock模块能通过简单的方法直接在建库流程中去除GlobinRNA,input量低至50ng的血液RNA。GlobinBlock模块与QuantSeq3’mRNA-Seq建库试剂盒搭配使用。GlobinBlockers在Quantseq流程中引入优化的GlobinRNA去除流程(RS-GlobinBlock):GlobinBlockers结合Globin***链cDNA,阻止GlobinmRNA形成双链cDNA。GlobinBlock兼容自动化平台,可用于人、猪样本。 北京表达谱文库构建Lexogen试剂盒