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Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 云生物专业致力于Lexogen试剂盒维修。山东Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒价格industryTemplate北京胶提取模块Lexogen试剂盒代理Lexogen试剂盒的好处您了解吗?
RiboCoprRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠):性能表现:RiboCop可高效地去除人类、大鼠和小鼠RNA样本中的rRNA(高达)。即使是高度降解的样本如FFPE(第3列),同样可以用RiboCop去除rRNA。通常回收率为RNAinput量的1-3%,同时高度取决于input的材料。此外,RiboCop的重复性极好。对于input量为100ng或10ng的UHRR样本,重复结果的相关性R2分别为。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒%的rRNA去除效率。RiboCop去除rRNA后,建库并在HiSeq仪器上测序。测序结果与rRNA参考序列比对,并以对应的未***rRNA的文库为参考进行定量。表格中的数据为100ng总RNA每反应的input量。UHRR—通用的人类参考RNA;HBRR—人类大脑参考RNA;mtrRNA—线粒体rRNA。
SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAM-ITseq:监测体内RNA的运输。组织特异性表达的尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)和基于4-Thiouracil标记的RNA也可用于监测组织间RNA的运输(Sharmaetal.,2018).SLAMdunk–SLAMseq数据分析软件:Lexogen可以为客户提供对SLAMdunk1的访问,可定制化分析来自QuantSeq3'mRNA-Seq文库的SLAMseqRNA-Seq数据。用户在Bluebee®Genomics平台上使用SLAMdunk软件可以很容易的对SLAMseq实验数据进行分析。只需上传压缩的fastq文件并选择适当的物种即可。处理数据之后,SLAMdunk可获得T>C转换率统计数据,以及比对到3'UTR区域的统计数据,然后可以从Bluebee®平台下载结果。SLAMseq,QuantSeq和SLAMdunk为高通量时间分辨RNA-Seq实验提供了完整且友好的解决方案。 Lexogen试剂盒的好处有很多。
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:在宏转录组样本上的性能表现:RiboCopMETArRNA去除试剂盒是专门针对复杂的样本而设计,用于混合细菌样本,如环境群落或微生物组样本的rRNA去除。RiboCopMETArRNA去除试剂盒的性能,样本为粪便提取的低质量微生物组样本。METArRNA去除试剂盒也可以用于单一菌株培养物,input量可达100ng总RNA。RiboCopMETArRNA去除试剂盒可有效的去除复杂的微生物组样本以及单一菌株样本中的rRNA,同时保持转录组结果的保真性。另外,RiboCop性能上优于竞品。不同RiboCoprRNA试剂盒:革兰氏阴性(G-)和革兰氏阳性(G+)细菌及混合细菌样本(META)对rRNA的去除效率。将大肠杆菌、枯草芽孢杆菌以及铜绿假单胞菌的100ng总RNA用相应的rRNA去除试剂盒进行处理。处理后样本用CORALL制备文库,在NextSeq500(1×75bp)上测序,并使用BBMap将数据比对到各自的参考基因组上,以评估每个类别的rRNAreads百分比。未处理的总RNA作为对照。rRNA百分比为两次以上实验的平均值。 Lexogen试剂盒的优点有很多。北京胶提取模块Lexogen试剂盒代理
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QuantSeq-Flex第二链合成模块 V2:QuantSeq-Flex第二链合成模块V2,在QuantSeq操作流程中随机的第二链合成引物可以被靶向特异性引物取代。*适用于QuantSeq FWD试剂盒(货号 015)。
货号、产品描述和规格如下:028.96QuanSeq-Flex Second Strand Symthesis Module for Illumina,96 preps96
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