北京Lexogen试剂盒
Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 Lexogen试剂盒的各种系列应用领域还是不一样的。北京Lexogen试剂盒
SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAMseq试剂盒从S4U标记条件的优化到进行S4U标记动力学实验,以及后续的RNA提取和烷基化,SLAMseq试剂盒为RNA代谢测序实验提供了一个完整的解决方案。产品应用:测定RNA合成及降解速率用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析,测定整个转录组的RNA周转率。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。 陕西胶提取Lexogen试剂盒代理Lexogen试剂盒的主要特点有很多。
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:在宏转录组样本上的性能表现:RiboCopMETArRNA去除试剂盒是专门针对复杂的样本而设计,用于混合细菌样本,如环境群落或微生物组样本的rRNA去除。RiboCopMETArRNA去除试剂盒的性能,样本为粪便提取的低质量微生物组样本。METArRNA去除试剂盒也可以用于单一菌株培养物,input量可达100ng总RNA。RiboCopMETArRNA去除试剂盒可有效的去除复杂的微生物组样本以及单一菌株样本中的rRNA,同时保持转录组结果的保真性。另外,RiboCop性能上优于竞品。不同RiboCoprRNA试剂盒:革兰氏阴性(G-)和革兰氏阳性(G+)细菌及混合细菌样本(META)对rRNA的去除效率。将大肠杆菌、枯草芽孢杆菌以及铜绿假单胞菌的100ng总RNA用相应的rRNA去除试剂盒进行处理。处理后样本用CORALL制备文库,在NextSeq500(1×75bp)上测序,并使用BBMap将数据比对到各自的参考基因组上,以评估每个类别的rRNAreads百分比。未处理的总RNA作为对照。rRNA百分比为两次以上实验的平均值。
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与***领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精细信息。Makers和质控品是**可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量和数据可比性。产品优势:通用的标准品,用于比较分析和监控整个RNA测序实验;验证RNA测序流程,发现测序错误的来源和偏差,改善RNA测序从建库到数据分析的整个流程;兼容所有的测序平台,各种生物来源的RNA,甚至单细胞水平的RNA;通过综合设计,*****isoform和转录组丰度的复杂性;提供三套不同的标准品(SIRV1,2,3),适用于复杂的isoform表达分析以及简单的样品之间的比较。工作流程:Spike-InRNAVariant(SIRV)对照质控品是人工转录本,*****了转录组的复杂性,实验过程中将其掺入样品(匀浆组织/细胞或纯化的RNA)中,标准品的数据量占总reads数的1-2%。通过SIRV的数据分析,可以评估RNA测序过程的精度和准确性,以确定每个处理样本的技术噪音。然后根据质量评测和偏差系数来计算实验之间的一致性。 上海Lexogen试剂盒代理哪家好?
Lexogen i5 6 nt UDI Add-on Kits (5001-5096):Lexogen 6碱基i5双Index Add-on试剂盒提供4个(5001-5004)或96个(5001-5096) Unique i5 index,与QuantSeq和CORALL Library Prep Kits兼容。96个 i5和96个i7 Indix结合使用,可实现多达9,216种不同的i5 / i7 index组合,从而 实现完全灵活的双端**的index。
货号产品描述规格047.4x24Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 24 rxn/Index4x24
047.4x96Lexogen i5 6 nt Dual Indexing Add-on Kit (5001-5004), 96 rxn/Index4x96
047.96Lexogen i5 6 nt Unique Dual Indexing Add-on Kit (5001-5096), 1rx/Index96 上海Lexogen试剂盒批发推荐云生物。山东Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒代理价格
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SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。 北京Lexogen试剂盒