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Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:Performance:3’端链特异性比对:以FDA提供的测序质控(SEQC)标准样品A和B为样本(A和B分别是ERCC外源RNA与有参RNA的混合物1和混合物2)1,2,用QuantSeq试剂盒进行文库构建,测序数据与近期生物分子资源设施协会(ABRF)发布的NGS研究中的mRNA-Seq数据组比对3。在标准mRNA-Seq中,测序Reads覆盖转录本的全长,而QuantSeq的Reads*覆盖转录本的3’端()。在该例子QuantSeq在精确的检测基因表达水平的同时,节省了大于90%的测序深度。由于spike-in转录本*来源于正义链的转录,因此链特异性的评估可以不依赖于于任何基因组注释。在各种情况下均显示出高于,而两个被评估的mRNA-SeqSEQC数据集(datasets)链特异性*分别为。QuantSeq可降低噪音,能够实现准确检测及定量反义转录本。QuantSeq量化范围宽--6个数量级:为了分析QuantSeq的基因计算准确性,用ERCC的spi-ke-in转录本覆盖reads数与input的分子数作图进行分析()。在线性模型评估和Spearman关联性评估中,QuantSeq展现出了非常高的input-output关联性和基因表达测定的准确性。 Lexogen试剂盒报价多少呢?上海RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒销售
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与***领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精细信息。Makers和质控品是**可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量和数据可比性。产品优势:通用的标准品,用于比较分析和监控整个RNA测序实验;验证RNA测序流程,发现测序错误的来源和偏差,改善RNA测序从建库到数据分析的整个流程;兼容所有的测序平台,各种生物来源的RNA,甚至单细胞水平的RNA;通过综合设计,*****isoform和转录组丰度的复杂性;提供三套不同的标准品(SIRV1,2,3),适用于复杂的isoform表达分析以及简单的样品之间的比较。工作流程:Spike-InRNAVariant(SIRV)对照质控品是人工转录本,*****了转录组的复杂性,实验过程中将其掺入样品(匀浆组织/细胞或纯化的RNA)中,标准品的数据量占总reads数的1-2%。通过SIRV的数据分析,可以评估RNA测序过程的精度和准确性,以确定每个处理样本的技术噪音。然后根据质量评测和偏差系数来计算实验之间的一致性。 陕西CORALL Total RNA-seq文库构建试剂盒Lexogen试剂盒哪家好云生物的Lexogen试剂盒产品种类繁多。
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:SIRV-Sets三套SIRV,每一套含有不同的SIRVMix或者Mix组合,满足不用的用途()。Table1|SIRV选择指南。SIRV-Set1(货号)包含Isoform模块的MixesE0、E1和E2;SIRV-Set2(货号and)*含IsoformMixE0;而SIRV-Set3(货号)包含SIRVIsoformMixE0和ERCCs.✔:**可用,:**不可用,部分可用(部分Set可用)。SIRV-Set1:SIRV-Set1含有3种不同的“isoform模块”:E0、E1和E2,每种混合物含有所有69种SIRVisoform转录本(来自7个SIRV基因),但浓度比例不同。在特定的RNA测序工作流程下,E0是评估isoform检测能力的理想选择,因为所有69种转录本都以等摩尔浓度存在,它们不作为测序深度的评估选择。E1中包含中等浓度的给定基因的各种转录本;E2**了一种自然的状态,1个基因的一种转录本占主要丰度(转录本可达17种isoform),其他低表达量的转录本小于1%。E2不*可以校正短读长的转录本检测,而且还可以对长读长或者限制读长的测序平台进行线性和灵敏度评测。
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:在宏转录组样本上的性能表现:RiboCopMETArRNA去除试剂盒是专门针对复杂的样本而设计,用于混合细菌样本,如环境群落或微生物组样本的rRNA去除。RiboCopMETArRNA去除试剂盒的性能,样本为粪便提取的低质量微生物组样本。METArRNA去除试剂盒也可以用于单一菌株培养物,input量可达100ng总RNA。RiboCopMETArRNA去除试剂盒可有效的去除复杂的微生物组样本以及单一菌株样本中的rRNA,同时保持转录组结果的保真性。另外,RiboCop性能上优于竞品。不同RiboCoprRNA试剂盒:革兰氏阴性(G-)和革兰氏阳性(G+)细菌及混合细菌样本(META)对rRNA的去除效率。将大肠杆菌、枯草芽孢杆菌以及铜绿假单胞菌的100ng总RNA用相应的rRNA去除试剂盒进行处理。处理后样本用CORALL制备文库,在NextSeq500(1×75bp)上测序,并使用BBMap将数据比对到各自的参考基因组上,以评估每个类别的rRNAreads百分比。未处理的总RNA作为对照。rRNA百分比为两次以上实验的平均值。 Lexogen试剂盒的不同系列会有不同的优势。
SPLITRNA提取试剂盒:SPLITRNA提取试剂盒是专门为需要RNA纯化的下游应用特别设计的,如RNA-Seq。它可快速高效的提取出DNA-free的RNA。更重要的,SPLIT无需DNase处理(DNase可能会对RNA造成损害)。SPLITRNA提取试剂盒既可以回收总RNA,还可以分别提取大片段的RNA和小片段的RNA。产品优势:可提取从17nt到大于10,000nt的TotalRNA;可以选择性的提取大片段或者小片段的RNA(Cut-off值在150nt左右);*需要30分钟;很高的RNA完整性和纯度(组织:RIN>8,细胞培养物:RIN10);试验过程无需DNase处理,且保证RNA中无基因组DNA;**的提取效率(低投入量,低至);本试剂盒可用于FFPE样本(样本需经过脱蜡处理);NEW!SPLITforblood试剂盒可去除人血液样本中的GlobinmRNAs。工作流程:SPLITRNA提取试剂盒可以简单、快捷、可靠地从不同物种(如哺乳动物、植物、昆虫、***和细菌)的多种材料(血浆、组织、细胞系)中提取RNA。样品在高盐提取缓冲液下匀浆,既可使RNase失活,又能提高样品的裂解。用酸性的酚-氯仿法抽提RNA,并辅以锁相凝胶管,将含RNA的水相与有机相(含DNA和蛋白质)清晰的分离开来。紧接着将RNA组分用硅胶柱纯化回收,既可回收总RNA,也可回收大片段或/和小片段RNA。 您喜欢Lexogen试剂盒的这些特点吗?上海Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒代理
Lexogen试剂盒的好处有很多。上海RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒销售
SmallRNA文库构建试剂盒:SmallRNA试剂盒建库流程简单,可在5个小时内完成smallRNA的建库(以totalRNA或富集好的smallRNA为模板)。可用于smallRNA的发现和分析,如microRNA或siRNA,这些smallRNA已被发现在基因表达调控中发挥关键作用。产品优势:5小时内即可完成测序文库的构建;input量范围宽:从50pg(富集好的smallRNA)或100ng(totalRNA)到1000ngRNA;适用于低RNA含量的样品,如血浆、血清和尿液;内含i7index,**多可同时对96个样品进行混样分析。工作流程:SmallRNA文库构建是通过将接头连接到TotalRNA或富集的smallRNA的3'和5'端。对于inputRNA,连接上5’端和3’端接头后,将反转录成cDNA,并通过PCR将i7端index引入到文库中,**多可以达96种index。通常情况下,特别是当inputRNA为富集好的microRNA时,构建好的文库可直接用于测序分析。对于totalRNA进行的smallRNA文库构建,可以用试剂盒中带的磁珠纯化模块除去接头自连片段,以及将smallRNA文库从totalRNA文库中分离出来。 上海RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒销售