四川QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒活动

时间：2021年04月24日来源：

SLAMseq代谢标记试剂盒：SLAM-ITseq:监测体内RNA的运输。组织特异性表达的尿嘧啶磷酸核糖基转移酶（UPRT）和基于4-Thiouracil标记的RNA也可用于监测组织间RNA的运输(Sharmaetal.,2018).SLAMdunk–SLAMseq数据分析软件：Lexogen可以为客户提供对SLAMdunk1的访问，可定制化分析来自QuantSeq3'mRNA-Seq文库的SLAMseqRNA-Seq数据。用户在Bluebee®Genomics平台上使用SLAMdunk软件可以很容易的对SLAMseq实验数据进行分析。只需上传压缩的fastq文件并选择适当的物种即可。处理数据之后，SLAMdunk可获得T>C转换率统计数据，以及比对到3'UTR区域的统计数据，然后可以从Bluebee®平台下载结果。SLAMseq，QuantSeq和SLAMdunk为高通量时间分辨RNA-Seq实验提供了完整且友好的解决方案。云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。四川QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒活动

TraPR功能性小RNA提取试剂盒：小RNA是基因表达的重要调控因子，并参与各种调控通路，如**、炎症和发育。此外，sRNAs可以作为疾病检测或监测的生物标记物，也可以作为药物靶点。这些sRNAs与Argonaute家族(AGOs)的特定蛋白结合，形成RNA诱导的沉默复合体(RISCs)，并引导AGO蛋白到达各自的靶点。目前特异性分离功能性sRNAs主要是通过免疫共沉淀(Co-IP)的方式。Co-IP是一种非常特异且灵敏的方法用于分离功能性sRNAs，但它有很大的局限性，**于一种感兴趣的生物体，需要昂贵且可用的抗体。另外，用商业化的sRNA提取试剂盒(膜柱法)对sRNA进行分离是一种比较快速、简单和廉价的方式，但特异性差，因为所有小于200nt的RNA都会被纯化。因此，RNAseq的大部分reads将被浪费在RNA降解产生的非功能性RN**段上。后者可通过繁琐的切胶回收等步骤来提高特异性，但是切胶回收仍然纯粹是基于片段的大小选择，因此不能区分功能性sRNAs和降解RN**段。迄今为止，还没有将AGOCo-IP的特异性与简单的商业化sRNA提取试剂盒相结合的方法。广东RiboCop细菌核糖体去除试剂盒Lexogen试剂盒云生物主营产品包括Lexogen试剂盒。

QuantSeq Data Analysis：

63.02 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-2 GB2 GB

63.06 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-6 GB6 GB

63.12 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-12 GB12 GB

63.25 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-25 GB25 GB

090.24 QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24 runs24

091.24 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24

093.03 QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

093.06 QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB

094.03 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

094.06 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB

SLAMseq代谢标记试剂盒：新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析：SLAMseq可以在同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达情况。为阐明常规、稳态RNA测序和SLAMseq代谢RNA测序之间的差异，Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muhar et al., 2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度(Fig. 3A)。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应，而常规RNA-Seq却不行。因此，SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。使用Lexogen试剂盒的好处您了解多少呢？

Quant-seq表达谱文库构建试剂盒：建库流程：QuantSeq 表达谱建库试剂盒通过oligo dT引物特异逆转录poly(A)尾3’mRNA，第二链使用随机引物进行合成。由于插入片段的大小是由第二链合成引物和poly(A)尾之间的距离决定的，因此无需额外进行 RN**段化。随后的PCR可以提供9,216个不同的i5/i7index组合用于Illumina平台，48个index 用于Ion Torrent平台。能够实现更多样本混样测序。Lexogen提供两个版本的Illumina Quantseq 表达谱建库试剂盒，不同处在于Illumina接头序列的位置。下图绿色的是Read 1的序列，蓝色的是Read 2的序列。QuantSeq Forward (FWD) 在第二链合成的引物中包含Read 1 序列。因此，测序的方向是朝向poly(A)尾的方向。推荐使用这种方法进行基因表达的分析。如果研究关注的是转录的3’端序列或者双端测序策略，推荐使用QuantSeq Reverse (REV)，Read 1 接头序列由oligo(dT)引物引入。Lexogen试剂盒的多种系列总有一款是您满意。上海RNA提取Lexogen试剂盒活动

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Quant-seq表达谱文库构建试剂盒：Quantseq在低质量RNA中的表现：Quantseq在高质量和低质量（FFPE）样本中有很好的相关性：用同一来源的不同质量RNA样本进行比较，评估Quantseq适用于高度降解的样本（如FFPE样本）的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份，一份进行新鲜冷冻，一份处理成FFPE样本，从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值（RNA完整度）来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本，RIN值不适用于质量的评估，因此使用DV200值（大于200nt的RN**段的分布值）来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后，FFPE样本的DV200值为87%（RIN值），冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA，用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA，即使DV200值低至23%（数据未显示）仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程，对应冷冻样本，应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高（R²=），表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。四川QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒活动

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