湖北QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒销售

时间:2021年04月21日 来源:

    Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒3’mRNA-Seq是基因表达谱分析的强有力工具。3’mRNA-Seq方法生成的NGS文库插入片段为多聚腺苷酸RNAs的3端,无需事先进行poly(A)富集处理(表1)。表1丨常规mRNA-Seq和QuantSeq3'mRNA-Seq基因表达谱分析方案比较。由于3'mRNA-seq每个转录本只产生一个文库片段,比对到给定基因的reads与其表达量成正比。3'mRNA-Seq不依赖于正确的异构体(isoform)注释和鉴定来确定确切基因表达值。此外,3'mRNA-Seq对RNA质量的差异不敏感。另一方面,传统的mRNA-seq需要高质量的RNA来富集mRNA,且对更长的转录本有偏好性,因为这些转录本产生更多的片段。因此,无论转录本长度如何,3'mRNA-Seq为基因表达谱提供了一个可靠且经济的解决方案1。 Lexogen试剂盒的主要特点有很多。湖北QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒销售

SLAMseq代谢标记试剂盒:新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析:SLAMseq可以在同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达情况。为阐明常规、稳态RNA测序和SLAMseq代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muhar et al., 2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度(Fig. 3A)。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而常规RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。天津Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒代理Lexogen试剂盒的优缺点您知道吗?

QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2:QuantSeq-FlexRNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行**链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。产品优势:试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;>100多重引物的靶向文库构建;每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;识别已知和未知融合转录本;只需;节省测序成本,Dualindex兼容多达9,216种组合(i5/i7组合)。工作流程:使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:1)Oligo(dT)用于**链合成,随机引物用于第二链合成(QuantseqFWD);2)Oligo(dT)用**链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’mRNA-Seq);3)特异性靶向引物用于**链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);4)特异性靶向引物用于**链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。

Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。

优势:

l 准确评估转录本浓度;

l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;

l 准确检测差异表达;

l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;

l 运算速度超快,且占用内存小。

工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 云生物销售的Lexogen试剂盒拥有完善的售后服务。


CORALLTotalRNA-seq文库构建试剂盒CORALL试剂盒:可以在(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。产品优势:完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析;整合UMIs,准确反映转录本信息;出色的链特异性(>99%)操作流程;低起始量(1ng-1μg),兼容mRNA捕获及核糖体去除建库;适用低起始量或低质量的FFPE样本;自动化友好。工作流程:CORALL文库构建基于特有的链置换终止和连接技术,首先置换终止引物(DSP,包含P7序列)3’端可随机结合到RNA模板上,然后进行反转录延伸,当延伸到下一个DSP时,延伸终止,因此文库构建过程不需要进行片段化。插入片段的大小取决于两个结合到模板RNA上DSP的距离。此外,这种终止可阻止伪第二链的合成,保持出色的链特异性。寡核苷酸连接序列可以与**链cDN**段的3’端进行高效的连接,同时引入P5序列和单分子标签(UMIs)。通过PCR进行第二链的合成和双链cDNA扩增,同时把i7和i5(可选)端index以及簇生成所需的完整接头序列引入到文库中。所有的核酸纯化都使用磁珠,操作流程高度匹配自动化。 云生物的Lexogen试剂盒产品种类繁多。陕西QuantSeq Data AnalysisLexogen试剂盒要多少钱

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    SLAMseq代谢标记试剂盒产品应用测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。 湖北QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒销售

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