山东磁珠纯化模块Lexogen试剂盒销售

时间:2021年04月19日 来源:

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 使用Lexogen试剂盒的好处您了解多少呢?山东磁珠纯化模块Lexogen试剂盒销售

    SPLITRNA提取试剂盒:SPLITRNA提取试剂盒是专门为需要RNA纯化的下游应用特别设计的,如RNA-Seq。它可快速高效的提取出DNA-free的RNA。更重要的,SPLIT无需DNase处理(DNase可能会对RNA造成损害)。SPLITRNA提取试剂盒既可以回收总RNA,还可以分别提取大片段的RNA和小片段的RNA。产品优势:可提取从17nt到大于10,000nt的TotalRNA;可以选择性的提取大片段或者小片段的RNA(Cut-off值在150nt左右);*需要30分钟;很高的RNA完整性和纯度(组织:RIN>8,细胞培养物:RIN10);试验过程无需DNase处理,且保证RNA中无基因组DNA;**的提取效率(低投入量,低至);本试剂盒可用于FFPE样本(样本需经过脱蜡处理);NEW!SPLITforblood试剂盒可去除人血液样本中的GlobinmRNAs。工作流程:SPLITRNA提取试剂盒可以简单、快捷、可靠地从不同物种(如哺乳动物、植物、昆虫、***和细菌)的多种材料(血浆、组织、细胞系)中提取RNA。样品在高盐提取缓冲液下匀浆,既可使RNase失活,又能提高样品的裂解。用酸性的酚-氯仿法抽提RNA,并辅以锁相凝胶管,将含RNA的水相与有机相(含DNA和蛋白质)清晰的分离开来。紧接着将RNA组分用硅胶柱纯化回收,既可回收总RNA,也可回收大片段或/和小片段RNA。 天津LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒要多少钱云生物专业致力于Lexogen试剂盒生产。

QuantSeq Data Analysis:

63.02   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-2 GB2 GB

63.06   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-6 GB6 GB

63.12   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-12 GB12 GB

63.25   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-25 GB25 GB

090.24  QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24   runs24

091.24 QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24

093.03 QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

093.06 QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB

094.03 QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

094.06 QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 Lexogen试剂盒的好处有很多。

    SLAMseq代谢标记试剂盒:标准的RNA-seq方法可以评估总RNA丰度,但不能解决RNA转录和降解整体动态水平的动力学问题。SLAMseq系列产品以时间作为RNA-Seq的一个新维度,能同时对新合成的和已有的RNA进行定量分析。产品优势:可进行转录组--RNA合成及降解的动力学分析;获取控制基因表达的新见解;建立刺激诱导的RNA转录和降解之间序列改变的模型;通过比较新生转录水平,***提高差异表达的分辨率;只需向RNA-Seq工作流添加两个步骤,无需pull-down实验或生化隔离;对于时间分辨的RNA-seq,整合了Lexogen’sSLAMseq标记试剂盒,QuantSeq3’mRNA-Seq文库构建试剂盒,以及SLAMdunk分析软件。工作流程:SLAMseq系列产品是基于一种新的全转录组定量、快速和可靠的标记方法:通过硫醇(SH)烷基化标记用于RNA的代谢测序1。用核苷酸类似物4-硫代嘌呤(4-Thiouridine,S4U)与细胞孵育,S4U被细胞摄入,并整合到新转录的,新生的RNA中。该工作流程的关键特点是烷基化步骤,使用碘乙酰胺(iodoacetamide,IAA)修饰S4U核苷酸,导致核苷酸在逆转录过程中发生转化。因此,S4U标记的转录本,在测序读取过程中,会导致胸腺嘧啶变成胞嘧啶(T>C)。 云生物主营产品很多,其中Lexogen试剂盒销量很好。山东QuantSeq Data AnalysisLexogen试剂盒哪家好

云生物销售的Lexogen试剂盒质量上乘。山东磁珠纯化模块Lexogen试剂盒销售

    SmallRNA文库构建试剂性能表现:与其他竞品相比,Lexogen small RNA建库试剂盒检出miRNA能力***,尤其在低起始量的时候。高灵敏度使其高度适用于具有挑战性、低含量的RNA样本,如液体活检(血浆、血清和尿液)以及外泌体。此外本试剂盒重现性***,不同的input量的结果也表现出超高的相关性。Lexogen small RNA文库构建试剂盒可以检测到更多的miRNA,尤其是在RNA低input量的情况下。以血浆RNA为样本,input量分别为6pg,60pg以及600pg,用4种不同试剂盒进行文库构建,对所得到的文库进行测序,每个样本获得相同的reads数约-2M,比较4种试剂盒检测到的总miRNA数量。在≥5个原始reads水平下,LexogensmallRNA-S文eq库构建试剂盒检测到更多的miRNA,尤其是在input量较低的情况下。 山东磁珠纯化模块Lexogen试剂盒销售

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