浙江Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

时间:2021年04月18日 来源:

    RiboCop细菌核糖体去除试剂盒在宏转录组样本上的性能表现:RiboCopMETArRNA去除试剂盒是专门针对复杂的样本而设计,用于混合细菌样本,如环境群落或微生物组样本的rRNA去除。RiboCopMETArRNA去除试剂盒的性能,样本为粪便提取的低质量微生物组样本。METArRNA去除试剂盒也可以用于单一菌株培养物,input量可达100ng总RNA。RiboCopMETArRNA去除试剂盒可有效的去除复杂的微生物组样本以及单一菌株样本中的rRNA,同时保持转录组结果的保真性。另外,RiboCop性能上优于竞品。不同RiboCoprRNA试剂盒:革兰氏阴性(G-)和革兰氏阳性(G+)细菌及混合细菌样本(META)对rRNA的去除效率。将大肠杆菌、枯草芽孢杆菌以及铜绿假单胞菌的100ng总RNA用相应的rRNA去除试剂盒进行处理。处理后样本用CORALL制备文库,在NextSeq500(1×75bp)上测序,并使用BBMap将数据比对到各自的参考基因组上,以评估每个类别的rRNAreads百分比。未处理的总RNA作为对照。rRNA百分比为两次以上实验的平均值。 一个好的Lexogen试剂盒需要具备哪些特点您了解吗?浙江Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

    GlobinBlock模块在血液RNA样本上的表现:使用GlobinBlock在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。GlobinmRNAs(HBA1,HBA2,HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因检测和定量的灵敏度。其他GlobinRNA的去除方法需要前处理RNA,需要高起始量的RNA,额外增加成本。LexogenQuantseq的GlobinBlock模块能通过简单的方法直接在建库流程中去除GlobinRNA,input量低至50ng的血液RNA。GlobinBlock模块与QuantSeq3’mRNA-Seq建库试剂盒搭配使用。GlobinBlockers在Quantseq流程中引入优化的GlobinRNA去除流程(RS-GlobinBlock):GlobinBlockers结合Globin***链cDNA,阻止GlobinmRNA形成双链cDNA。GlobinBlock兼容自动化平台,可用于人、猪样本。 湖北RNA提取Lexogen试剂盒销售厂家云生物就带您了解一下Lexogen试剂盒的特点。

    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Quantseq在低质量RNA中的表现Quantseq在高质量和低质量(FFPE)样本中有很好的相关性:用同一来源的不同质量RNA样本进行比较,评估Quantseq适用于高度降解的样本(如FFPE样本)的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份,一份进行新鲜冷冻,一份处理成FFPE样本,从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值(RNA完整度)来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本,RIN值不适用于质量的评估,因此使用DV200值(大于200nt的RN**段的分布值)来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后,FFPE样本的DV200值为87%(RIN值),冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA,用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA,即使DV200值低至23%(数据未显示)仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程,对应冷冻样本,应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高(R²=),表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。

    SIRVs-Spike-InRNA质控标准品设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 根据您的具体需求选择不同的Lexogen试剂盒系列。

QuantSeq-Flex第二链合成模块 V2:QuantSeq-Flex第二链合成模块V2,在QuantSeq操作流程中随机的第二链合成引物可以被靶向特异性引物取代。*适用于QuantSeq FWD试剂盒(货号 015)。

货号、产品描述和规格如下:028.96QuanSeq-Flex Second Strand Symthesis Module for Illumina,96 preps96

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028.96QuanSeq-Flex Second Strand Symthesis Module for Illumina,96 preps96 Lexogen试剂盒多种系列供您选择。上海Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Lexogen试剂盒代理价格

Lexogen试剂盒的优势您了解多少呢?浙江Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:QuantSeq3'mRNA-seq文库构建试剂盒是以mRNA靠近3'端序列进行文库构建,文库可兼容Illumina和IonTorrent测序平台。每个转录组本只产生一个片段,因此能准确进行基因表达定量,同时减少测序深度,能使更多样本混样测序。

产品优势:快速简单的一体化实验方案:从总RNA到可用于测序的文库时间不超过;每个转录本*有一个片段产生—可进行全基因组范围的基因表达分析;能稳定、灵敏检测低丰度的转录本;适用于低起始量(100pg(FWD)或10ng(REV)总RNA)及低质量RNA(如FFPE样本);可高效替代芯片检测或传统的RNA测序,友好匹配自动化工作站;在Blubee基因组分析平台上**进行数据分析;NEW!节约成本,优化的globinmRNA去除流程可用于QuantSeq文库构建;Dualindexes能支持9,216个i5/i7index,或者可选择96个uniqueindex,同时提供能够检测、排除扩增偏好性的UMIs。 浙江Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒报价

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