上海LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒活动

时间:2021年04月16日 来源:

QuantSeq-Flex**链合成模块:QuantSeq-Flex**链合成模块可在QuantSeq 操作流程中,允许反转录引物与 靶向特异性引物进行交换。如果需要,它还可以用QuantSeq 3'mRNA试剂 盒制备更长的文库。*适用于QuantSeq FWD试剂盒(货号015)。

货号、产品描述和规格如下:026.96QuantSeq-Flex First Strand Synthesis Module for Illumina,96 preps96

026.96QuantSeq-Flex First Strand Synthesis Module for Illumina,96 preps96

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Lexogen LUTHOR 3' mRNA-Seq单细胞建库试剂盒:细胞间的差异在多细胞生物中普遍存在。对单个细胞进行测序可以评估基因表达的异质性及相似类型或来源的细胞之间的异质性,并为鉴定细胞群、分类和亚型提供基础。传统的文库转化率只有所有转录本的10-20%。因此,目前的单细胞方法依赖于对数千个细胞进行测序通过增加数据测序深度来弥补低转换效率。然后只使用高丰度的marker转录本对细胞进行聚类。

THOR扩增技术和LUTHOR 3’mRNA-Seq:THOR稳定的扩增技术可对内源性mRNA模板直接进行线性复制生成更多RNA拷贝。原始mRNA与扩增所需的T7启动子融合。然后,RNA模板在体外转录产生反义RNA拷贝,但缺乏启动子序列。只有原始的mRNA分子作为模板,并被反复放大。从而提高RNA浓度,制备文库。文库是在一个高度特异性的链转换步骤中生成的。完整的LUTHOR工作流没有连接、模板转换和打断 ,因此可用于具有挑战性的样本。通过PCR扩增得到单链的cDNA,并引入与Illumina平台兼容的用于簇生成和i5、i7位置的UDIs的全长接头。Lexogen提供预混合的12nt UDIs index。


无与伦比的灵敏度

对于**input量和单细胞测序可获得高质量结果表现

优异的重现性


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Globin mRNA Block模块:

使用Globin Block在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物学及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。Globin mRNAs(HBA1, HBA2, HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因的检测和定量的灵敏度。其他Globin RNA的去除方法需要对RNA进行前处理,需要高起始量的RNA,额外增加成本。

Globin Block可降低Globin RNA Mapped Reads至0.7%:使用Globin Block模块的文库比标准Quantseq文库***降低了总Globin RNA mapped read百分比。在白膜层样品和全血中,使用Globin Block模块可使总Globin RNA mapped read百分比分别低至0.7%和9.7%。

QuantSeq 自动化:Lexogen可提供QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建流程的自动化版本。在自动化平台上构建Illumina兼容的 3’mRNA-Seq文库,能够提供9,216个i5 / i7 index组合,能实现高通量、大规模基因表达检测。自动化减少了手动操作的时间,提高通量,避免手动操作误差和样本错乱。

自动化 QuantSeq 数据分析:Bluebee Genomics Platform**为QuantSeq 3’ mRNASeq文库构建试剂盒(FWD和REV)的数据提供分析。Lexogen为每个试剂盒提供一个密码,使用者可以登录该平台分析数据。也可用Partek Flow (license required)平台进行数据分析。


    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Quantseq在低质量RNA中的表现Quantseq在高质量和低质量(FFPE)样本中有很好的相关性:用同一来源的不同质量RNA样本进行比较,评估Quantseq适用于高度降解的样本(如FFPE样本)的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份,一份进行新鲜冷冻,一份处理成FFPE样本,从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值(RNA完整度)来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本,RIN值不适用于质量的评估,因此使用DV200值(大于200nt的RN**段的分布值)来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后,FFPE样本的DV200值为87%(RIN值),冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA,用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA,即使DV200值低至23%(数据未显示)仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程,对应冷冻样本,应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高(R²=),表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。 Lexogen试剂盒的主要特点有很多。

PCR Add-on Kit for Illumina:用于Illumina平台的PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix、酶Mix和兼容的P7引 物,用于qPCR分析确定PCR的循环数。还包括再扩增引物,其可用于再扩增 Single-index(i7)文库。该Add-on Kit与QuantSeq及CORALL文库制备试剂盒兼容。

020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96

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