深圳AAV整合位点评估

2018年CTL019的一项临床试验中，一名B-ALL病人在接受CAR-CD19zhiliao28天后即达到CR，却在6个月后复发，PCR检测没有发现任何的RCL，结合持续性慢病毒插入位点的克隆丰度分析，研究者较终发现一个携带CAR插入位点的CAR-B细胞克隆。进而发现这个B细胞是CAR-T生产过程中的一个CAR-B副产物，而CAR在该B细胞上的顺式插入表达导致CAR靶标表位屏蔽，导致该B细胞克隆的耐药。这个案例也提示除去CAR-Tzhiliao方法本身的潜在风险外，CAR-T在生产工艺也会产生二次成瘤的风险。整合位点相比γ-逆转录病毒更安全但成本更高。深圳AAV整合位点评估

在国家药典委员会公布的《人用基因制品总论》（草案）的3.1条款中，特别指出：“应检测重组载体基因组或质粒的完整性和均一性，载体和zhiliao序列的遗传稳定性”；“对于病毒载体，适当情况下应测定插入位点，并充分评估插入突变的可能性和相关风险”。对此，可分别采用宿主细胞全基因组重测序方法和LM-PCR结合二代测序方法为研究人员提供整合位点检测服务。通过测序分析可对整合位点相关基因进行功能分析，对整合位点偏好性画像，从而评估病毒载体的安全性。宁波LV整合位点企业基因整合位点研究的方法主要有5种: 荧光原位杂交、个体基因组文库筛选法、反向PCR、接头PCR、锚定PCR。

慢病毒是逆转录病毒的一类，慢病毒整合到宿主细胞的染色体上可以长期稳定表达，并且与其他逆转录病毒（例如腺病毒）相比，慢病毒不但能ganran分裂期细胞，而且还能ganran非分裂期的细胞。基于以上优点，慢病毒载体（lentiviral vector）作为外源基因转移载体已广用于临床前基因研究及临床基因zhiliao。然而目前尚不能实现利用慢病毒载体将目的基因插入到特定位点，因此存在插入性突变致的风险。腺相关病毒（adeno-associated virus，AAV）是目前发现的一类结构较简单的单链DNA缺陷型病毒。而重组腺相关病毒载体(rAAV) 源于非致病的野生型腺相关病毒，具有安全性好、宿主细胞范围广和在体内表达时间长等特点，目前的科学界共识是AAV不会导致任何人类疾病，因此成为目前较有前景的基因zhiliao载体。然而，近年来不断有研究表明AVV可将外源基因片段插入到染色体上。

通常不需要进行标准的遗传毒性组合试验，但应根据基因zhiliao产品的特点、产品的具体适应症、载体的已有信息、导入基因序列结构等，评估基因zhiliao产品整合进基因组的可能性，判断是否需要开展另外的遗传毒性研究，如研究基因组修饰的发生情况，并检测随后可能发生的异常细胞行为；评估插入突变（插入位点、插入拷贝数等）引起的遗传毒性风险。当基因zhiliao产品采用基因编辑或转座子技术时，需要关注脱靶编辑、转座子转座印迹引起的遗传毒性问题；鉴定/表征基因组整合位点。目前,基因整合位点主要通过PCR方法分离并经测序鉴定。

全基因组测序是对重组细胞的基因组DNA进行深度测序，技术成熟简单这里不做介绍了，我们分享一下LM-PCR结合二代测序的检测方法。LM-PCR全称连接介导的PCR。将含有慢病毒插入的基因组进行随机打断并连接接头，然后通过两轮PCR富集含有慢病毒LTR-宿主区域的嵌合序列。此扩增产物进行二代测序即可以分析确定载体在宿主基因组上的整合位点。LM-PCR与高通量测序技术相结合后，有了更为丰富的应用场景。比如，识别整合载体（慢病毒载体，转座子）的整合位点。该技术广泛应用于基因zhiliao研究基因修饰细胞的克隆组成，或者通过研究整合事件评估新载体系统的生物安全性。慢病毒载体介导的转基因整合位点研究方法。深圳AAV整合位点评估

整合位点政策，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。深圳AAV整合位点评估

CAR-T慢病毒载体整合的潜在安全性隐患包括CAR-Tzhiliao在内的基因编辑性细胞zhiliao方法，采用慢病毒整合性载体将外源基因插入整合到细胞基因组中，某些插入位置可能会导致关键基因突变或jihuo原基因，从而导致恶性liu风险增加。因载体整合导致致瘤性基因变异及新发细胞变称为二次成瘤。在持续性细胞zhiliao过程中，这种潜在的成瘤性不良反应的发生时间往往会有明显的滞后性且很难预测。因此CAR-Tzhiliao需要评估潜在的插入突变风险和致性风险。深圳AAV整合位点评估