深圳病毒载体整合位点评估

应用场景：单克隆抗体药物辅助筛选；致xingbing毒整合位点检测与整合偏好性分析等；WGS不适用于转染之后未经过传代培养和表型筛选的细胞系。丰富的项目经验目前，唯可已与国内外多家免疫zhiliao研究前沿企业开展合作，采用该方法对高度异质性的CAR-T细胞进行整合位点检测与细胞安全性评估，具有较为丰富的项目经验。一般HBV插入到基因组中形成下图结构。使用三代测序，靶向插入区域的测序reads可分为Readsgroup1（HBV插入区域测通）和Readsgroup2（reads部分比对染色体，部分比对HBV插入区域）。基于三代数据比对后bam文件的IGV图，判断变异类型，推断断点类型和插入序列。慢病毒整合位点如何进行分析,用什么产品进行分析呢?深圳病毒载体整合位点评估

2018年CTL019的一项临床试验中，一名B-ALL病人在接受CAR-CD19zhiliao28天后即达到CR，却在6个月后复发，PCR检测没有发现任何的RCL，结合持续性慢病毒插入位点的克隆丰度分析，研究者较终发现一个携带CAR插入位点的CAR-B细胞克隆。进而发现这个B细胞是CAR-T生产过程中的一个CAR-B副产物，而CAR在该B细胞上的顺式插入表达导致CAR靶标表位屏蔽，导致该B细胞克隆的耐药。这个案例也提示除去CAR-Tzhiliao方法本身的潜在风险外，CAR-T在生产工艺也会产生二次成瘤的风险。整合位点服务整合位点安评，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。

慢病毒是逆转录病毒的一类，慢病毒整合到宿主细胞的染色体上可以长期稳定表达，并且与其他逆转录病毒（例如腺病毒）相比，慢病毒不但能ganran分裂期细胞，而且还能ganran非分裂期的细胞。基于以上优点，慢病毒载体（lentiviral vector）作为外源基因转移载体已广用于临床前基因研究及临床基因zhiliao。然而目前尚不能实现利用慢病毒载体将目的基因插入到特定位点，因此存在插入性突变致的风险。腺相关病毒（adeno-associated virus，AAV）是目前发现的一类结构较简单的单链DNA缺陷型病毒。而重组腺相关病毒载体(rAAV) 源于非致病的野生型腺相关病毒，具有安全性好、宿主细胞范围广和在体内表达时间长等特点，目前的科学界共识是AAV不会导致任何人类疾病，因此成为目前较有前景的基因zhiliao载体。然而，近年来不断有研究表明AVV可将外源基因片段插入到染色体上。

细胞和基因疗法可进一步分为体内zhiliao和体外zhiliao，体外zhiliao是将患者的体细胞从体内分离，在体外进行培养并使用携带有正常基因片段的载体修复突变基因，通过注射的方法将改良后的细胞回输入患者体内以进行疾病的zhiliao。体内zhiliao是利用较为直接的方法对局部或全身注射含有修复基因片段的病毒或非病毒载体，常用AAV等非整合型载体。利用慢病毒载体导入外源序列时其插入位置具有随机性，可能会引起正常基因失活，如果插入某些控制细胞分裂的基因中会导致变。所以检测重组细胞的整合位点来评价细胞的安全性就显得尤为重要。CAR-T慢病毒整合位点检测浅析。

使用脚本抓取Readsgroup1类型reads，根据比对结果进行统计，计算染色体断点位置以及HBV序列的断裂信息。唯可公司的整合位点分析服务采用LM-PCR方法，可以有效分析重组细胞外源序列的整合位点，充分评估插入突变的可能性和相关风险，保证重组细胞安全性，从而协助我们的客户顺利完成从课题研究到药品注册申报过程。聚焦基因zhiliao，唯可可以提供基因zhiliao几大主流工具：病毒基因组测序，CRISPR基因编辑后的测序服务。同时我们可以为客户提供高质量的可用于细胞ganran和动物实验的病毒服务。推出AAV-ITR测序方法，能够有效评估AAV质粒中ITR区域的完整性，迅速准确地检测到ITR区域的突变，为后续故障的排除节省时间和精力。下游我们同期推出重组细胞整合位点服务、基因编辑脱靶检测服务，确保重组/编辑细胞安全性。慢病毒插入位点检测浅析。南通AAV整合位点技术

LV整合位点，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。深圳病毒载体整合位点评估

靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。基于已有科学经验和既往非临床/临床研究结果，如果认为基因修饰细胞所采用的载体系统可将外源基因整合到细胞基因组中并可在体内长期存续，需综合分析以上风险因素，评估潜在的插入突变、致瘤/致性风险。非临床研究，应采用具有代表性的基因转导细胞进行基因整合位点分析，分析细胞的克隆组成以及在关注基因（如liu相关调控基因）附近有无优先整合迹象，含有关注整合位点的细胞有无优先异常增殖。深圳病毒载体整合位点评估