苏州ISA整合位点安全性评价

病毒载体介导的外源基因随机插入的可能风险之一是其可能整合到宿主细胞的原基因或抑基因内引发插入性诱变（insertionalmutagenesis），导致基因的jihuo或抑基因的抑制，从而诱导的发生。这些潜在的副作用已经引起人们的极大关注，因此亟需发展普适的整合位点检测手段来评估以病毒为载体的基因zhiliao的安全性。病毒载体整合位点检测能够特异性捕获整合位点序列，经过文库构建、二代测序及生物信息学分析，即可得出病毒载体在细胞中的整合位点。慢病毒载体在CAR-T细胞中的整合位点分析方法。苏州ISA整合位点安全性评价

长期随访的观察时间长期随访的持续时间应确保足以观察到受试者因产品特性、暴露情况（生物分布和给药途径）等导致的风险，应不短于迟发性不良反应的预期发生时间。一般而言，针对不同类型的基因zhiliao产品建议如下：具有基因组整合活性的载体（例如γ-逆转录病毒和慢病毒载体）和转座子元件建议观察不短于15年。可以产生持续ganran、或有潜伏再jihuo风险的细菌或病毒载体（如单纯疱疹病毒）建议观察15年或至数据表明不再存在任何风险（ganran或再jihuo）。南京ISA整合位点企业含有完整的外源DNA全部整合结构、插入位点旁侧序列和受体基因组在整合位点附近重排结构的CCS reads。

慢病毒整合事件要素及检测方法要求：对于食药监局指导性文件和既往研究内容，我们不难发现对于慢病毒整合检测所谓整合事件至少包含三个要素：整合位置；整合方向；特定整合位置和整合方向的juedui克隆数目；因此检测在定性和定量性能方面都有要求，检测方法需要结合临床样本进行分析性能进行系统验证。慢病毒整合位点检测方法，目前检测慢病毒整合位点的主要平台为高深度测序（NGS)。而目前较为成熟已经应用于工业产品检测及临床研究的整合位点富集建库方法为机械片段化及依赖于接头的扩增子建库(LM-PCR,如INSPIIRED),已经应用于多个CART19临床项目的安全性评估及与CAR-T细胞增值相关的回顾yao效学分析。

病人在6个月后达到MRD阴性，CAR-T细胞在4.2年后仍然可以在外周血检测到，并且骨髓中检测不到B细胞liu克隆。二代测序整合位点分析显示这是因为某些CAR-T细胞的融合位置位于TET2基因9号到10号外显子之间可变剪切区域，导致TET2基因跳读和功能障碍，从而产生短寿命记忆细胞扩增和长寿命记忆细胞。使得药物可以持久作用于病人。研究者继而进行插入位点和CAR-T细胞扩增及持续作用时间的相关研究，利用慢病毒插入位点信息（INSPIIRED）和LASSO logistic 回归模型进行插入位置和药效学分析，初步建立预测模型。研究者还建议在CAR-T产品回输前进行类似的多变量预测可以对产品的安全性和有效性进行更为有效的评估。病毒整合位点，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。

2020年9月发布的《细胞zhiliao产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》“生产工艺开发的技术要求”及“质量研究和质量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色体中的整合情况及提供细胞恶性转化（成瘤性和致瘤性）进行安全性研究和评估内容。2020年2月发布的《免疫细胞zhiliao产品临床试验技术指导原则（试行）》中规定：探索性临床试验的安全性和耐受性要考虑"外源基因随机整合到细胞基因组形成插入突变，导致成瘤性和恶性转化等"。转基因植物外源基因的检测方法及整合位点分析。连云港AAV整合位点方法

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f如果RCT设计不可行，申请人可能在确证性临床试验中采用单臂试验（singlearmtrial,SAT）。在这种情况下，申请人应解释无法开展RCT试验的理由并提供相应研究证据，并有必要利用回顾性数据、前瞻性真实世界研究、荟萃分析或流行病学调查等数据及探索性研究结果，对受试人群、主要终点和预期临床疗效等研究要素进行合理说明。RCT确证性试验应在可行的情况下尽量保持盲法。对于很多免疫细胞zhiliao产品，由于研究者或医务人员参与细胞的采集并配合操作给药过程，可能难以对研究者设盲，这种情况下有必要采用其它方法降低试验的偏倚，例如对受试者设盲。如果盲法不可行，如SAT，应设立不受研究者影响的单独审评委员会（independentreviewcommittee，IRC），对临床终点进行判读并作为主要终点的判定标准，或对研究者评估的结果进行敏感性分析。苏州ISA整合位点安全性评价